Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMCO3A2RU48 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms