RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.65■■■■■ 5.22
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.91■■■■■ 4.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ABCC9O60706 1549 aa40.61■■■■■ 4.09
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.76■■■■□ 3.96
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.34■■■■□ 3.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NACADO15069 1562 aa39.3■■■■□ 3.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.22■■■■□ 3.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.18■■■■□ 3.86
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SCRIBQ14160 1630 aa38.5■■■■□ 3.75
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.33■■■■□ 3.73
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.31■■■■□ 3.72
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.15■■■■□ 3.7
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.06■■■■□ 3.68
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.16■■■■□ 3.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.84■■■■□ 3.49
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SMARCA4P51532 1647 aa36.81■■■■□ 3.48
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.81■■■■□ 3.48
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.74■■■■□ 3.47
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.67■■■■□ 3.46
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.63■■■■□ 3.46
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.48■■■■□ 3.43
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WIZO95785 1651 aa36.43■■■■□ 3.42
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SMARCA2P51531 1590 aa36.39■■■■□ 3.42
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.37■■■■□ 3.41
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NCAPD3P42695 1498 aa36.31■■■■□ 3.4
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HMGXB3Q12766 1538 aa36.14■■■■□ 3.38
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.67■■■■□ 3.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NESP48681 1621 aa35.36■■■■□ 3.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.33■■■■□ 3.25
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CFTRP13569 1480 aa35.24■■■■□ 3.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.19■■■■□ 3.22
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.98■■■■□ 3.19
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.93■■■■□ 3.18
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRDM2Q13029 1718 aa34.89■■■■□ 3.18
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ERCC6Q03468 1493 aa34.89■■■■□ 3.18
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.85■■■■□ 3.17
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.79■■■■□ 3.16
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ABCC8Q09428 1581 aa34.62■■■■□ 3.13
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.59■■■■□ 3.13
SH3BGRL3-201ENST00000270792 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.56■■■■□ 3.12
SH3BGRL3-201ENST00000270792 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.5■■■■□ 3.11
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CUX1P39880 1505 aa34.47■■■■□ 3.11
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.46■■■■□ 3.11
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TOPBP1Q92547 1522 aa34.45■■■■□ 3.11
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WDR62O43379 1518 aa34.43■■■■□ 3.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.42■■■■□ 3.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SYNJ1O43426 1573 aa34.39■■■■□ 3.1
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TOP2BQ02880 1626 aa34.29■■■■□ 3.08
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.25■■■■□ 3.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.24■■■■□ 3.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRIM41Q8WV44 630 aa34.24■■■■□ 3.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.22■■■■□ 3.07
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CUX2O14529 1486 aa34.16■■■■□ 3.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.14■■■■□ 3.06
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SOGA1O94964 1423 aa34.1■■■■□ 3.05
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IFT140Q96RY7 1462 aa34.02■■■■□ 3.04
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.89■■■■□ 3.02
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WDR97A6NE52 1622 aa33.83■■■■□ 3.01
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.83■■■■□ 3.014e-6■■■■■ 31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.74■■■□□ 2.99
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIF27Q86VH2 1401 aa33.7■■■□□ 2.99
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.7■■■□□ 2.98
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.68■■■□□ 2.98
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.65■■■□□ 2.98
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GRIN2BQ13224 1484 aa33.57■■■□□ 2.96
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGF1RP08069 1367 aa33.53■■■□□ 2.96
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PBRM1Q86U86 1689 aa33.51■■■□□ 2.96
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.48■■■□□ 2.95
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.46■■■□□ 2.95
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EEA1Q15075 1411 aa33.44■■■□□ 2.94
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.44■■■□□ 2.94
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.37■■■□□ 2.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FBLN2P98095 1184 aa33.34■■■□□ 2.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.34■■■□□ 2.93
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ADAMTS12P58397 1594 aa33.32■■■□□ 2.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.3■■■□□ 2.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.28■■■□□ 2.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SYNJ2O15056 1496 aa33.27■■■□□ 2.92
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CUL7Q14999 1698 aa33.26■■■□□ 2.91
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.25■■■□□ 2.91
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRXQ9BXM0 1461 aa33.24■■■□□ 2.91
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.18■■■□□ 2.9
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GRIN2AQ12879 1464 aa33.16■■■□□ 2.9
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHD1O14646 1710 aa33.16■■■□□ 2.9
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.07■■■□□ 2.89
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KIF21BO75037 1637 aa33.06■■■□□ 2.88
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OSCARQ8IYS5 282 aa32.98■■■□□ 2.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CEP170Q5SW79 1584 aa32.98■■■□□ 2.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GOLGA3Q08378 1498 aa32.98■■■□□ 2.87
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NUP160Q12769 1436 aa32.96■■■□□ 2.87
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