Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ54

PMF1-BGLAP, HCG2044777, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1-BGLAPU3KQ54 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMF1-BGLAPU3KQ54 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMF1-BGLAPU3KQ54 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMF1-BGLAPU3KQ54 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PMF1-BGLAPU3KQ54 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMF1-BGLAPU3KQ54 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMF1-BGLAPU3KQ54 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMF1-BGLAPU3KQ54 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PMF1-BGLAPU3KQ54 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMF1-BGLAPU3KQ54 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMF1-BGLAPU3KQ54 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMF1-BGLAPU3KQ54 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMF1-BGLAPU3KQ54 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMF1-BGLAPU3KQ54 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMF1-BGLAPU3KQ54 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PMF1-BGLAPU3KQ54 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PMF1-BGLAPU3KQ54 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMF1-BGLAPU3KQ54 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMF1-BGLAPU3KQ54 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMF1-BGLAPU3KQ54 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PMF1-BGLAPU3KQ54 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMF1-BGLAPU3KQ54 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PMF1-BGLAPU3KQ54 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMF1-BGLAPU3KQ54 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMF1-BGLAPU3KQ54 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PMF1-BGLAPU3KQ54 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMF1-BGLAPU3KQ54 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMF1-BGLAPU3KQ54 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PMF1-BGLAPU3KQ54 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PMF1-BGLAPU3KQ54 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMF1-BGLAPU3KQ54 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMF1-BGLAPU3KQ54 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PMF1-BGLAPU3KQ54 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PMF1-BGLAPU3KQ54 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMF1-BGLAPU3KQ54 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMF1-BGLAPU3KQ54 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PMF1-BGLAPU3KQ54 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMF1-BGLAPU3KQ54 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMF1-BGLAPU3KQ54 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PMF1-BGLAPU3KQ54 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PMF1-BGLAPU3KQ54 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMF1-BGLAPU3KQ54 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMF1-BGLAPU3KQ54 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMF1-BGLAPU3KQ54 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PMF1-BGLAPU3KQ54 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMF1-BGLAPU3KQ54 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMF1-BGLAPU3KQ54 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMF1-BGLAPU3KQ54 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PMF1-BGLAPU3KQ54 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMF1-BGLAPU3KQ54 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PMF1-BGLAPU3KQ54 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMF1-BGLAPU3KQ54 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PMF1-BGLAPU3KQ54 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PMF1-BGLAPU3KQ54 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMF1-BGLAPU3KQ54 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMF1-BGLAPU3KQ54 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMF1-BGLAPU3KQ54 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMF1-BGLAPU3KQ54 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PMF1-BGLAPU3KQ54 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PMF1-BGLAPU3KQ54 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms