Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y678

COPG1, Coatomer subunit gamma-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG1Q9Y678 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COPG1Q9Y678 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPG1Q9Y678 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPG1Q9Y678 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COPG1Q9Y678 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPG1Q9Y678 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPG1Q9Y678 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COPG1Q9Y678 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPG1Q9Y678 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPG1Q9Y678 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COPG1Q9Y678 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPG1Q9Y678 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COPG1Q9Y678 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPG1Q9Y678 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPG1Q9Y678 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPG1Q9Y678 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPG1Q9Y678 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPG1Q9Y678 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPG1Q9Y678 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COPG1Q9Y678 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPG1Q9Y678 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COPG1Q9Y678 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COPG1Q9Y678 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPG1Q9Y678 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
COPG1Q9Y678 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COPG1Q9Y678 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COPG1Q9Y678 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COPG1Q9Y678 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COPG1Q9Y678 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COPG1Q9Y678 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPG1Q9Y678 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPG1Q9Y678 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPG1Q9Y678 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPG1Q9Y678 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPG1Q9Y678 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COPG1Q9Y678 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPG1Q9Y678 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPG1Q9Y678 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COPG1Q9Y678 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPG1Q9Y678 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
COPG1Q9Y678 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPG1Q9Y678 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COPG1Q9Y678 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPG1Q9Y678 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPG1Q9Y678 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPG1Q9Y678 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COPG1Q9Y678 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPG1Q9Y678 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COPG1Q9Y678 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPG1Q9Y678 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPG1Q9Y678 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPG1Q9Y678 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPG1Q9Y678 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPG1Q9Y678 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COPG1Q9Y678 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPG1Q9Y678 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPG1Q9Y678 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPG1Q9Y678 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPG1Q9Y678 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPG1Q9Y678 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
COPG1Q9Y678 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPG1Q9Y678 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPG1Q9Y678 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPG1Q9Y678 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPG1Q9Y678 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPG1Q9Y678 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
COPG1Q9Y678 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPG1Q9Y678 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPG1Q9Y678 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPG1Q9Y678 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPG1Q9Y678 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPG1Q9Y678 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COPG1Q9Y678 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPG1Q9Y678 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPG1Q9Y678 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COPG1Q9Y678 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPG1Q9Y678 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPG1Q9Y678 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPG1Q9Y678 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
COPG1Q9Y678 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COPG1Q9Y678 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COPG1Q9Y678 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPG1Q9Y678 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPG1Q9Y678 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPG1Q9Y678 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPG1Q9Y678 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPG1Q9Y678 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPG1Q9Y678 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPG1Q9Y678 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPG1Q9Y678 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPG1Q9Y678 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPG1Q9Y678 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPG1Q9Y678 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPG1Q9Y678 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPG1Q9Y678 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPG1Q9Y678 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPG1Q9Y678 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPG1Q9Y678 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPG1Q9Y678 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
COPG1Q9Y678 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms