Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y646

CPQ, Carboxypeptidase Q, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPQQ9Y646 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CPQQ9Y646 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CPQQ9Y646 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CPQQ9Y646 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CPQQ9Y646 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CPQQ9Y646 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPQQ9Y646 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPQQ9Y646 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPQQ9Y646 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPQQ9Y646 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPQQ9Y646 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPQQ9Y646 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPQQ9Y646 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPQQ9Y646 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPQQ9Y646 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CPQQ9Y646 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPQQ9Y646 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPQQ9Y646 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPQQ9Y646 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPQQ9Y646 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPQQ9Y646 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPQQ9Y646 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPQQ9Y646 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPQQ9Y646 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPQQ9Y646 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPQQ9Y646 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPQQ9Y646 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CPQQ9Y646 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPQQ9Y646 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CPQQ9Y646 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPQQ9Y646 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CPQQ9Y646 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPQQ9Y646 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPQQ9Y646 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CPQQ9Y646 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CPQQ9Y646 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CPQQ9Y646 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPQQ9Y646 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPQQ9Y646 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPQQ9Y646 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CPQQ9Y646 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CPQQ9Y646 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPQQ9Y646 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPQQ9Y646 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CPQQ9Y646 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPQQ9Y646 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPQQ9Y646 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPQQ9Y646 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CPQQ9Y646 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPQQ9Y646 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CPQQ9Y646 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPQQ9Y646 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CPQQ9Y646 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CPQQ9Y646 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPQQ9Y646 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPQQ9Y646 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPQQ9Y646 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPQQ9Y646 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPQQ9Y646 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPQQ9Y646 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPQQ9Y646 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPQQ9Y646 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPQQ9Y646 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPQQ9Y646 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPQQ9Y646 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPQQ9Y646 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPQQ9Y646 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPQQ9Y646 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPQQ9Y646 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CPQQ9Y646 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CPQQ9Y646 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CPQQ9Y646 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPQQ9Y646 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPQQ9Y646 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPQQ9Y646 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPQQ9Y646 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPQQ9Y646 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CPQQ9Y646 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CPQQ9Y646 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPQQ9Y646 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPQQ9Y646 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPQQ9Y646 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPQQ9Y646 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPQQ9Y646 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPQQ9Y646 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPQQ9Y646 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPQQ9Y646 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPQQ9Y646 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPQQ9Y646 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPQQ9Y646 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPQQ9Y646 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPQQ9Y646 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPQQ9Y646 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPQQ9Y646 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPQQ9Y646 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPQQ9Y646 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPQQ9Y646 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPQQ9Y646 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPQQ9Y646 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPQQ9Y646 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms