Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U2

TSSC4, Protein TSSC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC4Q9Y5U2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSSC4Q9Y5U2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSSC4Q9Y5U2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSSC4Q9Y5U2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSSC4Q9Y5U2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TSSC4Q9Y5U2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSSC4Q9Y5U2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TSSC4Q9Y5U2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSSC4Q9Y5U2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSSC4Q9Y5U2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TSSC4Q9Y5U2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSSC4Q9Y5U2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSSC4Q9Y5U2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSSC4Q9Y5U2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSSC4Q9Y5U2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSSC4Q9Y5U2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TSSC4Q9Y5U2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSC4Q9Y5U2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSC4Q9Y5U2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSC4Q9Y5U2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSC4Q9Y5U2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TSSC4Q9Y5U2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSSC4Q9Y5U2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSSC4Q9Y5U2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TSSC4Q9Y5U2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSSC4Q9Y5U2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSSC4Q9Y5U2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSSC4Q9Y5U2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSSC4Q9Y5U2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSSC4Q9Y5U2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSSC4Q9Y5U2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSSC4Q9Y5U2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSSC4Q9Y5U2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSSC4Q9Y5U2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSSC4Q9Y5U2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSSC4Q9Y5U2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSSC4Q9Y5U2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSSC4Q9Y5U2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSSC4Q9Y5U2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSSC4Q9Y5U2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSSC4Q9Y5U2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSSC4Q9Y5U2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSSC4Q9Y5U2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSSC4Q9Y5U2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSSC4Q9Y5U2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSSC4Q9Y5U2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSSC4Q9Y5U2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSSC4Q9Y5U2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSSC4Q9Y5U2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSSC4Q9Y5U2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSC4Q9Y5U2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSC4Q9Y5U2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSC4Q9Y5U2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSSC4Q9Y5U2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSSC4Q9Y5U2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSSC4Q9Y5U2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSSC4Q9Y5U2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSSC4Q9Y5U2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSSC4Q9Y5U2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSSC4Q9Y5U2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSSC4Q9Y5U2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSSC4Q9Y5U2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSSC4Q9Y5U2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSSC4Q9Y5U2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSSC4Q9Y5U2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TSSC4Q9Y5U2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TSSC4Q9Y5U2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TSSC4Q9Y5U2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms