Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HECTD4Q9Y4D8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HECTD4Q9Y4D8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HECTD4Q9Y4D8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HECTD4Q9Y4D8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HECTD4Q9Y4D8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HECTD4Q9Y4D8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HECTD4Q9Y4D8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HECTD4Q9Y4D8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HECTD4Q9Y4D8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HECTD4Q9Y4D8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HECTD4Q9Y4D8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HECTD4Q9Y4D8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HECTD4Q9Y4D8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HECTD4Q9Y4D8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HECTD4Q9Y4D8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HECTD4Q9Y4D8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HECTD4Q9Y4D8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HECTD4Q9Y4D8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HECTD4Q9Y4D8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HECTD4Q9Y4D8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HECTD4Q9Y4D8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HECTD4Q9Y4D8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HECTD4Q9Y4D8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HECTD4Q9Y4D8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
HECTD4Q9Y4D8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HECTD4Q9Y4D8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HECTD4Q9Y4D8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HECTD4Q9Y4D8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HECTD4Q9Y4D8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HECTD4Q9Y4D8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HECTD4Q9Y4D8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HECTD4Q9Y4D8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HECTD4Q9Y4D8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms