Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
RAD54L2Q9Y4B4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC44.39■■■■■ 4.7
RAD54L2Q9Y4B4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
RAD54L2Q9Y4B4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC44.39■■■■■ 4.7
RAD54L2Q9Y4B4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
RAD54L2Q9Y4B4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
RAD54L2Q9Y4B4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
RAD54L2Q9Y4B4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
RAD54L2Q9Y4B4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC44.34■■■■■ 4.69
RAD54L2Q9Y4B4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
RAD54L2Q9Y4B4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
RAD54L2Q9Y4B4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
RAD54L2Q9Y4B4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
RAD54L2Q9Y4B4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC44.31■■■■■ 4.68
RAD54L2Q9Y4B4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.3■■■■■ 4.68
RAD54L2Q9Y4B4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
RAD54L2Q9Y4B4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
RAD54L2Q9Y4B4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
RAD54L2Q9Y4B4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC44.29■■■■■ 4.68
RAD54L2Q9Y4B4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
RAD54L2Q9Y4B4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
RAD54L2Q9Y4B4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
RAD54L2Q9Y4B4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.25■■■■■ 4.67
RAD54L2Q9Y4B4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
RAD54L2Q9Y4B4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
RAD54L2Q9Y4B4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC44.23■■■■■ 4.67
RAD54L2Q9Y4B4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC44.23■■■■■ 4.67
RAD54L2Q9Y4B4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
RAD54L2Q9Y4B4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
RAD54L2Q9Y4B4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
RAD54L2Q9Y4B4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.22■■■■■ 4.67
RAD54L2Q9Y4B4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC44.21■■■■■ 4.67
RAD54L2Q9Y4B4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
RAD54L2Q9Y4B4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
RAD54L2Q9Y4B4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
RAD54L2Q9Y4B4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
RAD54L2Q9Y4B4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
RAD54L2Q9Y4B4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
RAD54L2Q9Y4B4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC44.17■■■■■ 4.66
RAD54L2Q9Y4B4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
RAD54L2Q9Y4B4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
RAD54L2Q9Y4B4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC44.15■■■■■ 4.66
RAD54L2Q9Y4B4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
RAD54L2Q9Y4B4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
RAD54L2Q9Y4B4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
RAD54L2Q9Y4B4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
RAD54L2Q9Y4B4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC44.11■■■■■ 4.65
RAD54L2Q9Y4B4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
RAD54L2Q9Y4B4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC44.1■■■■■ 4.65
RAD54L2Q9Y4B4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC44.1■■■■■ 4.65
RAD54L2Q9Y4B4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
RAD54L2Q9Y4B4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
RAD54L2Q9Y4B4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
RAD54L2Q9Y4B4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC44.08■■■■■ 4.65
RAD54L2Q9Y4B4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC44.07■■■■■ 4.65
RAD54L2Q9Y4B4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.07■■■■■ 4.65
RAD54L2Q9Y4B4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC44.07■■■■■ 4.65
RAD54L2Q9Y4B4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC44.07■■■■■ 4.64
RAD54L2Q9Y4B4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
RAD54L2Q9Y4B4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
RAD54L2Q9Y4B4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
RAD54L2Q9Y4B4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
RAD54L2Q9Y4B4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
RAD54L2Q9Y4B4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC44.03■■■■■ 4.64
RAD54L2Q9Y4B4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC44.03■■■■■ 4.64
RAD54L2Q9Y4B4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
RAD54L2Q9Y4B4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC44.01■■■■■ 4.64
RAD54L2Q9Y4B4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.01■■■■■ 4.64
RAD54L2Q9Y4B4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
RAD54L2Q9Y4B4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
RAD54L2Q9Y4B4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
RAD54L2Q9Y4B4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
RAD54L2Q9Y4B4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC43.99■■■■■ 4.63
RAD54L2Q9Y4B4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC43.98■■■■■ 4.63
RAD54L2Q9Y4B4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC43.97■■■■■ 4.63
RAD54L2Q9Y4B4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC43.97■■■■■ 4.63
RAD54L2Q9Y4B4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
RAD54L2Q9Y4B4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC43.96■■■■■ 4.63
RAD54L2Q9Y4B4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
RAD54L2Q9Y4B4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.91■■■■■ 4.62
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
RAD54L2Q9Y4B4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC43.91■■■■■ 4.62
RAD54L2Q9Y4B4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC43.91■■■■■ 4.62
RAD54L2Q9Y4B4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
RAD54L2Q9Y4B4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC43.89■■■■■ 4.62
RAD54L2Q9Y4B4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC43.89■■■■■ 4.62
RAD54L2Q9Y4B4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
RAD54L2Q9Y4B4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
RAD54L2Q9Y4B4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
RAD54L2Q9Y4B4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
RAD54L2Q9Y4B4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
RAD54L2Q9Y4B4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.88■■■■■ 4.61
RAD54L2Q9Y4B4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
RAD54L2Q9Y4B4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
RAD54L2Q9Y4B4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.87■■■■■ 4.61
RAD54L2Q9Y4B4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms