Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHTOPQ9Y3Y2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHTOPQ9Y3Y2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHTOPQ9Y3Y2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHTOPQ9Y3Y2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHTOPQ9Y3Y2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHTOPQ9Y3Y2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHTOPQ9Y3Y2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHTOPQ9Y3Y2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHTOPQ9Y3Y2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHTOPQ9Y3Y2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHTOPQ9Y3Y2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHTOPQ9Y3Y2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHTOPQ9Y3Y2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHTOPQ9Y3Y2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHTOPQ9Y3Y2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHTOPQ9Y3Y2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHTOPQ9Y3Y2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHTOPQ9Y3Y2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHTOPQ9Y3Y2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHTOPQ9Y3Y2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHTOPQ9Y3Y2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHTOPQ9Y3Y2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHTOPQ9Y3Y2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHTOPQ9Y3Y2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHTOPQ9Y3Y2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHTOPQ9Y3Y2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHTOPQ9Y3Y2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHTOPQ9Y3Y2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTOPQ9Y3Y2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTOPQ9Y3Y2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHTOPQ9Y3Y2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHTOPQ9Y3Y2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHTOPQ9Y3Y2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHTOPQ9Y3Y2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHTOPQ9Y3Y2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHTOPQ9Y3Y2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHTOPQ9Y3Y2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHTOPQ9Y3Y2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHTOPQ9Y3Y2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHTOPQ9Y3Y2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHTOPQ9Y3Y2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHTOPQ9Y3Y2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHTOPQ9Y3Y2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHTOPQ9Y3Y2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHTOPQ9Y3Y2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHTOPQ9Y3Y2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHTOPQ9Y3Y2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHTOPQ9Y3Y2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHTOPQ9Y3Y2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHTOPQ9Y3Y2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHTOPQ9Y3Y2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHTOPQ9Y3Y2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHTOPQ9Y3Y2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHTOPQ9Y3Y2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHTOPQ9Y3Y2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHTOPQ9Y3Y2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHTOPQ9Y3Y2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHTOPQ9Y3Y2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHTOPQ9Y3Y2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CHTOPQ9Y3Y2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHTOPQ9Y3Y2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHTOPQ9Y3Y2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHTOPQ9Y3Y2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHTOPQ9Y3Y2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHTOPQ9Y3Y2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CHTOPQ9Y3Y2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHTOPQ9Y3Y2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHTOPQ9Y3Y2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHTOPQ9Y3Y2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms