Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDD3Q9Y3P4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDD3Q9Y3P4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDD3Q9Y3P4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RHBDD3Q9Y3P4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHBDD3Q9Y3P4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDD3Q9Y3P4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDD3Q9Y3P4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDD3Q9Y3P4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDD3Q9Y3P4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHBDD3Q9Y3P4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDD3Q9Y3P4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHBDD3Q9Y3P4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDD3Q9Y3P4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDD3Q9Y3P4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDD3Q9Y3P4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDD3Q9Y3P4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHBDD3Q9Y3P4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDD3Q9Y3P4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDD3Q9Y3P4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDD3Q9Y3P4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDD3Q9Y3P4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHBDD3Q9Y3P4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDD3Q9Y3P4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDD3Q9Y3P4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHBDD3Q9Y3P4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDD3Q9Y3P4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDD3Q9Y3P4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHBDD3Q9Y3P4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDD3Q9Y3P4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHBDD3Q9Y3P4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDD3Q9Y3P4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDD3Q9Y3P4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDD3Q9Y3P4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDD3Q9Y3P4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDD3Q9Y3P4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDD3Q9Y3P4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RHBDD3Q9Y3P4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDD3Q9Y3P4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDD3Q9Y3P4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDD3Q9Y3P4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDD3Q9Y3P4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHBDD3Q9Y3P4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHBDD3Q9Y3P4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDD3Q9Y3P4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDD3Q9Y3P4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDD3Q9Y3P4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHBDD3Q9Y3P4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDD3Q9Y3P4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDD3Q9Y3P4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHBDD3Q9Y3P4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDD3Q9Y3P4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDD3Q9Y3P4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHBDD3Q9Y3P4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHBDD3Q9Y3P4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDD3Q9Y3P4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDD3Q9Y3P4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDD3Q9Y3P4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDD3Q9Y3P4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHBDD3Q9Y3P4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDD3Q9Y3P4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDD3Q9Y3P4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RHBDD3Q9Y3P4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDD3Q9Y3P4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDD3Q9Y3P4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RHBDD3Q9Y3P4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RHBDD3Q9Y3P4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDD3Q9Y3P4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RHBDD3Q9Y3P4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDD3Q9Y3P4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDD3Q9Y3P4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDD3Q9Y3P4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDD3Q9Y3P4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RHBDD3Q9Y3P4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDD3Q9Y3P4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDD3Q9Y3P4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDD3Q9Y3P4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDD3Q9Y3P4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RHBDD3Q9Y3P4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RHBDD3Q9Y3P4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDD3Q9Y3P4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDD3Q9Y3P4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDD3Q9Y3P4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDD3Q9Y3P4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RHBDD3Q9Y3P4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDD3Q9Y3P4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDD3Q9Y3P4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDD3Q9Y3P4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDD3Q9Y3P4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHBDD3Q9Y3P4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDD3Q9Y3P4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDD3Q9Y3P4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHBDD3Q9Y3P4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDD3Q9Y3P4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDD3Q9Y3P4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHBDD3Q9Y3P4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms