Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1DQ9Y2S0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR1DQ9Y2S0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1DQ9Y2S0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1DQ9Y2S0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1DQ9Y2S0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1DQ9Y2S0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1DQ9Y2S0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1DQ9Y2S0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR1DQ9Y2S0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
POLR1DQ9Y2S0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1DQ9Y2S0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR1DQ9Y2S0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1DQ9Y2S0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1DQ9Y2S0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1DQ9Y2S0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR1DQ9Y2S0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1DQ9Y2S0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1DQ9Y2S0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1DQ9Y2S0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1DQ9Y2S0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1DQ9Y2S0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR1DQ9Y2S0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1DQ9Y2S0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1DQ9Y2S0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1DQ9Y2S0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1DQ9Y2S0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1DQ9Y2S0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1DQ9Y2S0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1DQ9Y2S0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1DQ9Y2S0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1DQ9Y2S0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1DQ9Y2S0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1DQ9Y2S0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR1DQ9Y2S0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1DQ9Y2S0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1DQ9Y2S0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1DQ9Y2S0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1DQ9Y2S0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1DQ9Y2S0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1DQ9Y2S0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1DQ9Y2S0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1DQ9Y2S0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1DQ9Y2S0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1DQ9Y2S0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1DQ9Y2S0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1DQ9Y2S0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1DQ9Y2S0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1DQ9Y2S0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR1DQ9Y2S0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1DQ9Y2S0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1DQ9Y2S0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1DQ9Y2S0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1DQ9Y2S0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1DQ9Y2S0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
POLR1DQ9Y2S0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1DQ9Y2S0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1DQ9Y2S0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1DQ9Y2S0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
POLR1DQ9Y2S0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1DQ9Y2S0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1DQ9Y2S0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
POLR1DQ9Y2S0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1DQ9Y2S0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1DQ9Y2S0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR1DQ9Y2S0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1DQ9Y2S0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1DQ9Y2S0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1DQ9Y2S0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR1DQ9Y2S0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR1DQ9Y2S0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms