Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP8A1Q9Y2Q0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP8A1Q9Y2Q0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP8A1Q9Y2Q0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP8A1Q9Y2Q0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP8A1Q9Y2Q0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP8A1Q9Y2Q0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP8A1Q9Y2Q0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP8A1Q9Y2Q0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP8A1Q9Y2Q0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP8A1Q9Y2Q0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP8A1Q9Y2Q0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP8A1Q9Y2Q0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP8A1Q9Y2Q0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP8A1Q9Y2Q0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATP8A1Q9Y2Q0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP8A1Q9Y2Q0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP8A1Q9Y2Q0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP8A1Q9Y2Q0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP8A1Q9Y2Q0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP8A1Q9Y2Q0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATP8A1Q9Y2Q0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP8A1Q9Y2Q0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP8A1Q9Y2Q0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATP8A1Q9Y2Q0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP8A1Q9Y2Q0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATP8A1Q9Y2Q0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP8A1Q9Y2Q0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP8A1Q9Y2Q0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP8A1Q9Y2Q0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATP8A1Q9Y2Q0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP8A1Q9Y2Q0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATP8A1Q9Y2Q0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP8A1Q9Y2Q0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP8A1Q9Y2Q0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP8A1Q9Y2Q0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP8A1Q9Y2Q0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP8A1Q9Y2Q0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP8A1Q9Y2Q0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP8A1Q9Y2Q0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP8A1Q9Y2Q0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP8A1Q9Y2Q0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATP8A1Q9Y2Q0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP8A1Q9Y2Q0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8A1Q9Y2Q0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8A1Q9Y2Q0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8A1Q9Y2Q0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP8A1Q9Y2Q0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP8A1Q9Y2Q0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP8A1Q9Y2Q0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP8A1Q9Y2Q0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP8A1Q9Y2Q0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP8A1Q9Y2Q0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP8A1Q9Y2Q0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms