Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN79

SOX13, Transcription factor SOX-13, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX13Q9UN79 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SOX13Q9UN79 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SOX13Q9UN79 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SOX13Q9UN79 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX13Q9UN79 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX13Q9UN79 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX13Q9UN79 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX13Q9UN79 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX13Q9UN79 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SOX13Q9UN79 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SOX13Q9UN79 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOX13Q9UN79 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOX13Q9UN79 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOX13Q9UN79 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SOX13Q9UN79 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX13Q9UN79 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX13Q9UN79 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX13Q9UN79 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SOX13Q9UN79 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX13Q9UN79 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX13Q9UN79 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX13Q9UN79 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX13Q9UN79 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOX13Q9UN79 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOX13Q9UN79 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOX13Q9UN79 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SOX13Q9UN79 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SOX13Q9UN79 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOX13Q9UN79 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOX13Q9UN79 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOX13Q9UN79 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SOX13Q9UN79 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX13Q9UN79 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX13Q9UN79 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX13Q9UN79 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX13Q9UN79 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX13Q9UN79 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX13Q9UN79 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX13Q9UN79 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX13Q9UN79 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SOX13Q9UN79 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX13Q9UN79 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX13Q9UN79 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX13Q9UN79 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SOX13Q9UN79 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOX13Q9UN79 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOX13Q9UN79 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOX13Q9UN79 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SOX13Q9UN79 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOX13Q9UN79 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOX13Q9UN79 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SOX13Q9UN79 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX13Q9UN79 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX13Q9UN79 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SOX13Q9UN79 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOX13Q9UN79 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SOX13Q9UN79 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SOX13Q9UN79 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SOX13Q9UN79 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX13Q9UN79 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX13Q9UN79 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX13Q9UN79 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX13Q9UN79 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX13Q9UN79 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX13Q9UN79 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX13Q9UN79 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SOX13Q9UN79 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOX13Q9UN79 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOX13Q9UN79 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOX13Q9UN79 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX13Q9UN79 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX13Q9UN79 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX13Q9UN79 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX13Q9UN79 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SOX13Q9UN79 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOX13Q9UN79 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOX13Q9UN79 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOX13Q9UN79 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SOX13Q9UN79 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX13Q9UN79 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX13Q9UN79 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX13Q9UN79 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX13Q9UN79 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SOX13Q9UN79 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX13Q9UN79 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX13Q9UN79 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX13Q9UN79 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX13Q9UN79 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SOX13Q9UN79 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SOX13Q9UN79 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOX13Q9UN79 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOX13Q9UN79 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOX13Q9UN79 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SOX13Q9UN79 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOX13Q9UN79 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOX13Q9UN79 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOX13Q9UN79 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOX13Q9UN79 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SOX13Q9UN79 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SOX13Q9UN79 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms