Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FZD4Q9ULV1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FZD4Q9ULV1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FZD4Q9ULV1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FZD4Q9ULV1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FZD4Q9ULV1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FZD4Q9ULV1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FZD4Q9ULV1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FZD4Q9ULV1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FZD4Q9ULV1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FZD4Q9ULV1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FZD4Q9ULV1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FZD4Q9ULV1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FZD4Q9ULV1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FZD4Q9ULV1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FZD4Q9ULV1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FZD4Q9ULV1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FZD4Q9ULV1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FZD4Q9ULV1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FZD4Q9ULV1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FZD4Q9ULV1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FZD4Q9ULV1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FZD4Q9ULV1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FZD4Q9ULV1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FZD4Q9ULV1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FZD4Q9ULV1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FZD4Q9ULV1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FZD4Q9ULV1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FZD4Q9ULV1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FZD4Q9ULV1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FZD4Q9ULV1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FZD4Q9ULV1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FZD4Q9ULV1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FZD4Q9ULV1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FZD4Q9ULV1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FZD4Q9ULV1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FZD4Q9ULV1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FZD4Q9ULV1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FZD4Q9ULV1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FZD4Q9ULV1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FZD4Q9ULV1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FZD4Q9ULV1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FZD4Q9ULV1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FZD4Q9ULV1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FZD4Q9ULV1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FZD4Q9ULV1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FZD4Q9ULV1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FZD4Q9ULV1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FZD4Q9ULV1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FZD4Q9ULV1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FZD4Q9ULV1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FZD4Q9ULV1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FZD4Q9ULV1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FZD4Q9ULV1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FZD4Q9ULV1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FZD4Q9ULV1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FZD4Q9ULV1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FZD4Q9ULV1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FZD4Q9ULV1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FZD4Q9ULV1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FZD4Q9ULV1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FZD4Q9ULV1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FZD4Q9ULV1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FZD4Q9ULV1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FZD4Q9ULV1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FZD4Q9ULV1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FZD4Q9ULV1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FZD4Q9ULV1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FZD4Q9ULV1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FZD4Q9ULV1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FZD4Q9ULV1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms