Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC4

MCTS1, Malignant T-cell-amplified sequence 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTS1Q9ULC4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTS1Q9ULC4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCTS1Q9ULC4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTS1Q9ULC4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTS1Q9ULC4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTS1Q9ULC4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTS1Q9ULC4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTS1Q9ULC4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTS1Q9ULC4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTS1Q9ULC4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTS1Q9ULC4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTS1Q9ULC4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTS1Q9ULC4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCTS1Q9ULC4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCTS1Q9ULC4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MCTS1Q9ULC4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCTS1Q9ULC4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCTS1Q9ULC4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCTS1Q9ULC4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCTS1Q9ULC4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCTS1Q9ULC4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCTS1Q9ULC4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCTS1Q9ULC4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCTS1Q9ULC4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCTS1Q9ULC4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCTS1Q9ULC4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MCTS1Q9ULC4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCTS1Q9ULC4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCTS1Q9ULC4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCTS1Q9ULC4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MCTS1Q9ULC4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCTS1Q9ULC4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCTS1Q9ULC4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCTS1Q9ULC4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCTS1Q9ULC4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCTS1Q9ULC4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCTS1Q9ULC4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCTS1Q9ULC4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCTS1Q9ULC4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MCTS1Q9ULC4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCTS1Q9ULC4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCTS1Q9ULC4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCTS1Q9ULC4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCTS1Q9ULC4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCTS1Q9ULC4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MCTS1Q9ULC4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTS1Q9ULC4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCTS1Q9ULC4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCTS1Q9ULC4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCTS1Q9ULC4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCTS1Q9ULC4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCTS1Q9ULC4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCTS1Q9ULC4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCTS1Q9ULC4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCTS1Q9ULC4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCTS1Q9ULC4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCTS1Q9ULC4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCTS1Q9ULC4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCTS1Q9ULC4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCTS1Q9ULC4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCTS1Q9ULC4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MCTS1Q9ULC4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MCTS1Q9ULC4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MCTS1Q9ULC4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCTS1Q9ULC4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCTS1Q9ULC4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCTS1Q9ULC4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCTS1Q9ULC4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCTS1Q9ULC4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCTS1Q9ULC4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCTS1Q9ULC4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCTS1Q9ULC4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCTS1Q9ULC4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCTS1Q9ULC4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTS1Q9ULC4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTS1Q9ULC4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTS1Q9ULC4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTS1Q9ULC4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTS1Q9ULC4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCTS1Q9ULC4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCTS1Q9ULC4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCTS1Q9ULC4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCTS1Q9ULC4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCTS1Q9ULC4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCTS1Q9ULC4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCTS1Q9ULC4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCTS1Q9ULC4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCTS1Q9ULC4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCTS1Q9ULC4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCTS1Q9ULC4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MCTS1Q9ULC4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCTS1Q9ULC4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCTS1Q9ULC4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCTS1Q9ULC4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MCTS1Q9ULC4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MCTS1Q9ULC4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MCTS1Q9ULC4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MCTS1Q9ULC4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MCTS1Q9ULC4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MCTS1Q9ULC4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms