Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM4Q9UKN5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM4Q9UKN5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM4Q9UKN5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM4Q9UKN5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM4Q9UKN5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRDM4Q9UKN5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM4Q9UKN5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM4Q9UKN5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM4Q9UKN5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRDM4Q9UKN5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PRDM4Q9UKN5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM4Q9UKN5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM4Q9UKN5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM4Q9UKN5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRDM4Q9UKN5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM4Q9UKN5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM4Q9UKN5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRDM4Q9UKN5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM4Q9UKN5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRDM4Q9UKN5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM4Q9UKN5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM4Q9UKN5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM4Q9UKN5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRDM4Q9UKN5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM4Q9UKN5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM4Q9UKN5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM4Q9UKN5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM4Q9UKN5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRDM4Q9UKN5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM4Q9UKN5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM4Q9UKN5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM4Q9UKN5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRDM4Q9UKN5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRDM4Q9UKN5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM4Q9UKN5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM4Q9UKN5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM4Q9UKN5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM4Q9UKN5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM4Q9UKN5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM4Q9UKN5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM4Q9UKN5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM4Q9UKN5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM4Q9UKN5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM4Q9UKN5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM4Q9UKN5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM4Q9UKN5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM4Q9UKN5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM4Q9UKN5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM4Q9UKN5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM4Q9UKN5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM4Q9UKN5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM4Q9UKN5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM4Q9UKN5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM4Q9UKN5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM4Q9UKN5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM4Q9UKN5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM4Q9UKN5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM4Q9UKN5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM4Q9UKN5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM4Q9UKN5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM4Q9UKN5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM4Q9UKN5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM4Q9UKN5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM4Q9UKN5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM4Q9UKN5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM4Q9UKN5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM4Q9UKN5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRDM4Q9UKN5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PRDM4Q9UKN5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRDM4Q9UKN5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM4Q9UKN5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM4Q9UKN5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM4Q9UKN5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRDM4Q9UKN5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM4Q9UKN5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM4Q9UKN5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM4Q9UKN5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRDM4Q9UKN5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRDM4Q9UKN5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM4Q9UKN5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRDM4Q9UKN5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM4Q9UKN5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM4Q9UKN5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM4Q9UKN5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRDM4Q9UKN5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM4Q9UKN5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM4Q9UKN5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM4Q9UKN5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRDM4Q9UKN5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM4Q9UKN5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM4Q9UKN5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRDM4Q9UKN5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM4Q9UKN5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM4Q9UKN5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM4Q9UKN5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM4Q9UKN5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRDM4Q9UKN5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM4Q9UKN5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRDM4Q9UKN5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms