Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSR3Q9UJK0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSR3Q9UJK0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSR3Q9UJK0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSR3Q9UJK0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSR3Q9UJK0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSR3Q9UJK0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSR3Q9UJK0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSR3Q9UJK0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSR3Q9UJK0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TSR3Q9UJK0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TSR3Q9UJK0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSR3Q9UJK0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSR3Q9UJK0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSR3Q9UJK0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSR3Q9UJK0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSR3Q9UJK0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR3Q9UJK0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR3Q9UJK0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR3Q9UJK0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR3Q9UJK0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR3Q9UJK0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR3Q9UJK0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR3Q9UJK0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR3Q9UJK0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR3Q9UJK0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR3Q9UJK0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR3Q9UJK0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSR3Q9UJK0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TSR3Q9UJK0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TSR3Q9UJK0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSR3Q9UJK0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSR3Q9UJK0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TSR3Q9UJK0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSR3Q9UJK0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSR3Q9UJK0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR3Q9UJK0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR3Q9UJK0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR3Q9UJK0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR3Q9UJK0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR3Q9UJK0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR3Q9UJK0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR3Q9UJK0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSR3Q9UJK0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR3Q9UJK0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR3Q9UJK0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR3Q9UJK0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR3Q9UJK0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR3Q9UJK0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSR3Q9UJK0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSR3Q9UJK0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSR3Q9UJK0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSR3Q9UJK0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSR3Q9UJK0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TSR3Q9UJK0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSR3Q9UJK0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSR3Q9UJK0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR3Q9UJK0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR3Q9UJK0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR3Q9UJK0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR3Q9UJK0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSR3Q9UJK0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSR3Q9UJK0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSR3Q9UJK0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSR3Q9UJK0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSR3Q9UJK0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR3Q9UJK0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR3Q9UJK0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR3Q9UJK0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TSR3Q9UJK0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR3Q9UJK0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSR3Q9UJK0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSR3Q9UJK0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSR3Q9UJK0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSR3Q9UJK0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSR3Q9UJK0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSR3Q9UJK0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSR3Q9UJK0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSR3Q9UJK0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSR3Q9UJK0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSR3Q9UJK0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSR3Q9UJK0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSR3Q9UJK0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSR3Q9UJK0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSR3Q9UJK0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TSR3Q9UJK0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSR3Q9UJK0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSR3Q9UJK0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSR3Q9UJK0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSR3Q9UJK0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSR3Q9UJK0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR3Q9UJK0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR3Q9UJK0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR3Q9UJK0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR3Q9UJK0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSR3Q9UJK0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR3Q9UJK0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSR3Q9UJK0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TSR3Q9UJK0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSR3Q9UJK0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms