Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
NPC1L1Q9UHC9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
NPC1L1Q9UHC9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
NPC1L1Q9UHC9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.43■■■■□ 3.26
NPC1L1Q9UHC9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NPC1L1Q9UHC9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NPC1L1Q9UHC9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NPC1L1Q9UHC9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NPC1L1Q9UHC9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NPC1L1Q9UHC9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NPC1L1Q9UHC9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NPC1L1Q9UHC9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.38■■■■□ 3.26
NPC1L1Q9UHC9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NPC1L1Q9UHC9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NPC1L1Q9UHC9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NPC1L1Q9UHC9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NPC1L1Q9UHC9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NPC1L1Q9UHC9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NPC1L1Q9UHC9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NPC1L1Q9UHC9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NPC1L1Q9UHC9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NPC1L1Q9UHC9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NPC1L1Q9UHC9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NPC1L1Q9UHC9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NPC1L1Q9UHC9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NPC1L1Q9UHC9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
NPC1L1Q9UHC9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
NPC1L1Q9UHC9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NPC1L1Q9UHC9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NPC1L1Q9UHC9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NPC1L1Q9UHC9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NPC1L1Q9UHC9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
NPC1L1Q9UHC9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NPC1L1Q9UHC9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NPC1L1Q9UHC9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
NPC1L1Q9UHC9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
NPC1L1Q9UHC9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
NPC1L1Q9UHC9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
NPC1L1Q9UHC9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NPC1L1Q9UHC9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
NPC1L1Q9UHC9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NPC1L1Q9UHC9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NPC1L1Q9UHC9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NPC1L1Q9UHC9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NPC1L1Q9UHC9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NPC1L1Q9UHC9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NPC1L1Q9UHC9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NPC1L1Q9UHC9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NPC1L1Q9UHC9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NPC1L1Q9UHC9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NPC1L1Q9UHC9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NPC1L1Q9UHC9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
NPC1L1Q9UHC9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
NPC1L1Q9UHC9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NPC1L1Q9UHC9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
NPC1L1Q9UHC9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NPC1L1Q9UHC9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NPC1L1Q9UHC9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
NPC1L1Q9UHC9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
NPC1L1Q9UHC9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
NPC1L1Q9UHC9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
NPC1L1Q9UHC9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NPC1L1Q9UHC9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
NPC1L1Q9UHC9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NPC1L1Q9UHC9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NPC1L1Q9UHC9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
NPC1L1Q9UHC9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NPC1L1Q9UHC9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NPC1L1Q9UHC9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NPC1L1Q9UHC9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NPC1L1Q9UHC9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NPC1L1Q9UHC9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NPC1L1Q9UHC9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NPC1L1Q9UHC9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NPC1L1Q9UHC9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NPC1L1Q9UHC9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NPC1L1Q9UHC9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NPC1L1Q9UHC9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NPC1L1Q9UHC9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NPC1L1Q9UHC9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
NPC1L1Q9UHC9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NPC1L1Q9UHC9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NPC1L1Q9UHC9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NPC1L1Q9UHC9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NPC1L1Q9UHC9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NPC1L1Q9UHC9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NPC1L1Q9UHC9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NPC1L1Q9UHC9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NPC1L1Q9UHC9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NPC1L1Q9UHC9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NPC1L1Q9UHC9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NPC1L1Q9UHC9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NPC1L1Q9UHC9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NPC1L1Q9UHC9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NPC1L1Q9UHC9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NPC1L1Q9UHC9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NPC1L1Q9UHC9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NPC1L1Q9UHC9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NPC1L1Q9UHC9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NPC1L1Q9UHC9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms