Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ5

EIF3K, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3KQ9UBQ5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3KQ9UBQ5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3KQ9UBQ5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EIF3KQ9UBQ5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EIF3KQ9UBQ5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3KQ9UBQ5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3KQ9UBQ5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3KQ9UBQ5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3KQ9UBQ5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3KQ9UBQ5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3KQ9UBQ5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3KQ9UBQ5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3KQ9UBQ5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3KQ9UBQ5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3KQ9UBQ5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3KQ9UBQ5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3KQ9UBQ5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3KQ9UBQ5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3KQ9UBQ5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3KQ9UBQ5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3KQ9UBQ5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3KQ9UBQ5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3KQ9UBQ5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3KQ9UBQ5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3KQ9UBQ5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3KQ9UBQ5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3KQ9UBQ5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3KQ9UBQ5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3KQ9UBQ5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3KQ9UBQ5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3KQ9UBQ5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3KQ9UBQ5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3KQ9UBQ5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3KQ9UBQ5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3KQ9UBQ5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3KQ9UBQ5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3KQ9UBQ5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3KQ9UBQ5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3KQ9UBQ5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3KQ9UBQ5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3KQ9UBQ5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EIF3KQ9UBQ5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3KQ9UBQ5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3KQ9UBQ5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3KQ9UBQ5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3KQ9UBQ5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3KQ9UBQ5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3KQ9UBQ5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3KQ9UBQ5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3KQ9UBQ5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3KQ9UBQ5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EIF3KQ9UBQ5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3KQ9UBQ5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3KQ9UBQ5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EIF3KQ9UBQ5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3KQ9UBQ5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3KQ9UBQ5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3KQ9UBQ5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3KQ9UBQ5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3KQ9UBQ5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3KQ9UBQ5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3KQ9UBQ5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3KQ9UBQ5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3KQ9UBQ5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3KQ9UBQ5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3KQ9UBQ5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3KQ9UBQ5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3KQ9UBQ5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3KQ9UBQ5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms