Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA3

GOLGA6A, Golgin subfamily A member 6A, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6AQ9NYA3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6AQ9NYA3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GOLGA6AQ9NYA3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GOLGA6AQ9NYA3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GOLGA6AQ9NYA3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GOLGA6AQ9NYA3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GOLGA6AQ9NYA3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GOLGA6AQ9NYA3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GOLGA6AQ9NYA3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GOLGA6AQ9NYA3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GOLGA6AQ9NYA3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GOLGA6AQ9NYA3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GOLGA6AQ9NYA3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GOLGA6AQ9NYA3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GOLGA6AQ9NYA3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6AQ9NYA3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6AQ9NYA3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6AQ9NYA3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GOLGA6AQ9NYA3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GOLGA6AQ9NYA3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOLGA6AQ9NYA3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOLGA6AQ9NYA3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOLGA6AQ9NYA3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GOLGA6AQ9NYA3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GOLGA6AQ9NYA3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GOLGA6AQ9NYA3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA6AQ9NYA3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA6AQ9NYA3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA6AQ9NYA3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA6AQ9NYA3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA6AQ9NYA3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA6AQ9NYA3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA6AQ9NYA3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA6AQ9NYA3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6AQ9NYA3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6AQ9NYA3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6AQ9NYA3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6AQ9NYA3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6AQ9NYA3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6AQ9NYA3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA6AQ9NYA3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA6AQ9NYA3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA6AQ9NYA3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA6AQ9NYA3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA6AQ9NYA3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6AQ9NYA3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6AQ9NYA3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6AQ9NYA3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6AQ9NYA3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6AQ9NYA3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6AQ9NYA3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6AQ9NYA3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA6AQ9NYA3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA6AQ9NYA3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA6AQ9NYA3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA6AQ9NYA3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA6AQ9NYA3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA6AQ9NYA3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA6AQ9NYA3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA6AQ9NYA3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GOLGA6AQ9NYA3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GOLGA6AQ9NYA3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GOLGA6AQ9NYA3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA6AQ9NYA3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA6AQ9NYA3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA6AQ9NYA3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA6AQ9NYA3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA6AQ9NYA3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6AQ9NYA3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6AQ9NYA3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6AQ9NYA3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GOLGA6AQ9NYA3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GOLGA6AQ9NYA3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GOLGA6AQ9NYA3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6AQ9NYA3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6AQ9NYA3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6AQ9NYA3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GOLGA6AQ9NYA3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GOLGA6AQ9NYA3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GOLGA6AQ9NYA3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA6AQ9NYA3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA6AQ9NYA3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GOLGA6AQ9NYA3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6AQ9NYA3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6AQ9NYA3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6AQ9NYA3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6AQ9NYA3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6AQ9NYA3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GOLGA6AQ9NYA3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA6AQ9NYA3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA6AQ9NYA3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GOLGA6AQ9NYA3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA6AQ9NYA3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA6AQ9NYA3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA6AQ9NYA3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA6AQ9NYA3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA6AQ9NYA3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GOLGA6AQ9NYA3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA6AQ9NYA3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GOLGA6AQ9NYA3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms