Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP26Q9NRE1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP26Q9NRE1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP26Q9NRE1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP26Q9NRE1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP26Q9NRE1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP26Q9NRE1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP26Q9NRE1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP26Q9NRE1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP26Q9NRE1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP26Q9NRE1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP26Q9NRE1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP26Q9NRE1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP26Q9NRE1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP26Q9NRE1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP26Q9NRE1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP26Q9NRE1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP26Q9NRE1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP26Q9NRE1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP26Q9NRE1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP26Q9NRE1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MMP26Q9NRE1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MMP26Q9NRE1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MMP26Q9NRE1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MMP26Q9NRE1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MMP26Q9NRE1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MMP26Q9NRE1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MMP26Q9NRE1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MMP26Q9NRE1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MMP26Q9NRE1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MMP26Q9NRE1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MMP26Q9NRE1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MMP26Q9NRE1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MMP26Q9NRE1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MMP26Q9NRE1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MMP26Q9NRE1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MMP26Q9NRE1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MMP26Q9NRE1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MMP26Q9NRE1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MMP26Q9NRE1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MMP26Q9NRE1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MMP26Q9NRE1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MMP26Q9NRE1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MMP26Q9NRE1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MMP26Q9NRE1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MMP26Q9NRE1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MMP26Q9NRE1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP26Q9NRE1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP26Q9NRE1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP26Q9NRE1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP26Q9NRE1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MMP26Q9NRE1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP26Q9NRE1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MMP26Q9NRE1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP26Q9NRE1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP26Q9NRE1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP26Q9NRE1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP26Q9NRE1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP26Q9NRE1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP26Q9NRE1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MMP26Q9NRE1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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