Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
BIN3Q9NQY0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
BIN3Q9NQY0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BIN3Q9NQY0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
BIN3Q9NQY0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BIN3Q9NQY0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BIN3Q9NQY0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BIN3Q9NQY0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
BIN3Q9NQY0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BIN3Q9NQY0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BIN3Q9NQY0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
BIN3Q9NQY0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BIN3Q9NQY0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BIN3Q9NQY0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BIN3Q9NQY0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BIN3Q9NQY0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
BIN3Q9NQY0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
BIN3Q9NQY0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BIN3Q9NQY0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BIN3Q9NQY0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BIN3Q9NQY0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BIN3Q9NQY0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BIN3Q9NQY0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BIN3Q9NQY0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
BIN3Q9NQY0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BIN3Q9NQY0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BIN3Q9NQY0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BIN3Q9NQY0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BIN3Q9NQY0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BIN3Q9NQY0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BIN3Q9NQY0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BIN3Q9NQY0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BIN3Q9NQY0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BIN3Q9NQY0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BIN3Q9NQY0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BIN3Q9NQY0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BIN3Q9NQY0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BIN3Q9NQY0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BIN3Q9NQY0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BIN3Q9NQY0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BIN3Q9NQY0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BIN3Q9NQY0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BIN3Q9NQY0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BIN3Q9NQY0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BIN3Q9NQY0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BIN3Q9NQY0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BIN3Q9NQY0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BIN3Q9NQY0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BIN3Q9NQY0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BIN3Q9NQY0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BIN3Q9NQY0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BIN3Q9NQY0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BIN3Q9NQY0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BIN3Q9NQY0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BIN3Q9NQY0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BIN3Q9NQY0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BIN3Q9NQY0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BIN3Q9NQY0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BIN3Q9NQY0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BIN3Q9NQY0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BIN3Q9NQY0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BIN3Q9NQY0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BIN3Q9NQY0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BIN3Q9NQY0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BIN3Q9NQY0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BIN3Q9NQY0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BIN3Q9NQY0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BIN3Q9NQY0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
BIN3Q9NQY0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BIN3Q9NQY0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BIN3Q9NQY0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BIN3Q9NQY0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BIN3Q9NQY0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BIN3Q9NQY0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BIN3Q9NQY0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BIN3Q9NQY0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BIN3Q9NQY0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BIN3Q9NQY0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BIN3Q9NQY0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BIN3Q9NQY0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BIN3Q9NQY0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BIN3Q9NQY0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BIN3Q9NQY0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BIN3Q9NQY0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BIN3Q9NQY0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BIN3Q9NQY0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BIN3Q9NQY0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BIN3Q9NQY0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BIN3Q9NQY0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BIN3Q9NQY0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BIN3Q9NQY0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BIN3Q9NQY0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BIN3Q9NQY0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BIN3Q9NQY0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BIN3Q9NQY0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BIN3Q9NQY0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
BIN3Q9NQY0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BIN3Q9NQY0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BIN3Q9NQY0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BIN3Q9NQY0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms