Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASS4Q9NQ75 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CASS4Q9NQ75 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASS4Q9NQ75 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CASS4Q9NQ75 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CASS4Q9NQ75 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CASS4Q9NQ75 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASS4Q9NQ75 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASS4Q9NQ75 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CASS4Q9NQ75 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CASS4Q9NQ75 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASS4Q9NQ75 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASS4Q9NQ75 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CASS4Q9NQ75 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CASS4Q9NQ75 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CASS4Q9NQ75 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASS4Q9NQ75 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASS4Q9NQ75 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CASS4Q9NQ75 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASS4Q9NQ75 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASS4Q9NQ75 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASS4Q9NQ75 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASS4Q9NQ75 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASS4Q9NQ75 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CASS4Q9NQ75 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CASS4Q9NQ75 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CASS4Q9NQ75 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASS4Q9NQ75 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASS4Q9NQ75 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASS4Q9NQ75 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CASS4Q9NQ75 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASS4Q9NQ75 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASS4Q9NQ75 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASS4Q9NQ75 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASS4Q9NQ75 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASS4Q9NQ75 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASS4Q9NQ75 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CASS4Q9NQ75 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASS4Q9NQ75 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CASS4Q9NQ75 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CASS4Q9NQ75 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASS4Q9NQ75 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CASS4Q9NQ75 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASS4Q9NQ75 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASS4Q9NQ75 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CASS4Q9NQ75 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASS4Q9NQ75 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASS4Q9NQ75 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASS4Q9NQ75 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASS4Q9NQ75 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASS4Q9NQ75 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASS4Q9NQ75 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASS4Q9NQ75 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CASS4Q9NQ75 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASS4Q9NQ75 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASS4Q9NQ75 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASS4Q9NQ75 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASS4Q9NQ75 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASS4Q9NQ75 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASS4Q9NQ75 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASS4Q9NQ75 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASS4Q9NQ75 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASS4Q9NQ75 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASS4Q9NQ75 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASS4Q9NQ75 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CASS4Q9NQ75 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASS4Q9NQ75 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASS4Q9NQ75 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASS4Q9NQ75 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASS4Q9NQ75 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASS4Q9NQ75 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms