Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LHX9Q9NQ69 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LHX9Q9NQ69 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHX9Q9NQ69 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LHX9Q9NQ69 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHX9Q9NQ69 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LHX9Q9NQ69 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX9Q9NQ69 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX9Q9NQ69 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX9Q9NQ69 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX9Q9NQ69 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LHX9Q9NQ69 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LHX9Q9NQ69 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LHX9Q9NQ69 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LHX9Q9NQ69 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX9Q9NQ69 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX9Q9NQ69 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LHX9Q9NQ69 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX9Q9NQ69 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX9Q9NQ69 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LHX9Q9NQ69 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX9Q9NQ69 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX9Q9NQ69 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX9Q9NQ69 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LHX9Q9NQ69 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX9Q9NQ69 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX9Q9NQ69 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX9Q9NQ69 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX9Q9NQ69 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LHX9Q9NQ69 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX9Q9NQ69 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX9Q9NQ69 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX9Q9NQ69 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LHX9Q9NQ69 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LHX9Q9NQ69 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LHX9Q9NQ69 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LHX9Q9NQ69 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LHX9Q9NQ69 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LHX9Q9NQ69 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LHX9Q9NQ69 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LHX9Q9NQ69 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LHX9Q9NQ69 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LHX9Q9NQ69 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LHX9Q9NQ69 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LHX9Q9NQ69 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LHX9Q9NQ69 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX9Q9NQ69 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LHX9Q9NQ69 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LHX9Q9NQ69 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LHX9Q9NQ69 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LHX9Q9NQ69 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX9Q9NQ69 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX9Q9NQ69 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX9Q9NQ69 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LHX9Q9NQ69 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
LHX9Q9NQ69 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LHX9Q9NQ69 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LHX9Q9NQ69 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LHX9Q9NQ69 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LHX9Q9NQ69 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LHX9Q9NQ69 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LHX9Q9NQ69 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LHX9Q9NQ69 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LHX9Q9NQ69 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LHX9Q9NQ69 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LHX9Q9NQ69 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LHX9Q9NQ69 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LHX9Q9NQ69 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LHX9Q9NQ69 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LHX9Q9NQ69 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LHX9Q9NQ69 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX9Q9NQ69 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX9Q9NQ69 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX9Q9NQ69 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX9Q9NQ69 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX9Q9NQ69 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX9Q9NQ69 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LHX9Q9NQ69 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX9Q9NQ69 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LHX9Q9NQ69 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LHX9Q9NQ69 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LHX9Q9NQ69 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LHX9Q9NQ69 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LHX9Q9NQ69 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LHX9Q9NQ69 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LHX9Q9NQ69 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LHX9Q9NQ69 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LHX9Q9NQ69 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LHX9Q9NQ69 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LHX9Q9NQ69 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX9Q9NQ69 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX9Q9NQ69 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX9Q9NQ69 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX9Q9NQ69 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX9Q9NQ69 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LHX9Q9NQ69 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX9Q9NQ69 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LHX9Q9NQ69 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX9Q9NQ69 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LHX9Q9NQ69 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms