Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6K4

OPA3, Optic atrophy 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPA3Q9H6K4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OPA3Q9H6K4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
OPA3Q9H6K4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
OPA3Q9H6K4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OPA3Q9H6K4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPA3Q9H6K4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPA3Q9H6K4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPA3Q9H6K4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPA3Q9H6K4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPA3Q9H6K4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPA3Q9H6K4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPA3Q9H6K4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
OPA3Q9H6K4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPA3Q9H6K4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPA3Q9H6K4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPA3Q9H6K4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPA3Q9H6K4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPA3Q9H6K4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPA3Q9H6K4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPA3Q9H6K4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OPA3Q9H6K4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
OPA3Q9H6K4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OPA3Q9H6K4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
OPA3Q9H6K4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OPA3Q9H6K4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPA3Q9H6K4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPA3Q9H6K4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPA3Q9H6K4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPA3Q9H6K4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPA3Q9H6K4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
OPA3Q9H6K4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OPA3Q9H6K4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
OPA3Q9H6K4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OPA3Q9H6K4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
OPA3Q9H6K4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
OPA3Q9H6K4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
OPA3Q9H6K4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OPA3Q9H6K4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OPA3Q9H6K4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OPA3Q9H6K4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
OPA3Q9H6K4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OPA3Q9H6K4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OPA3Q9H6K4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OPA3Q9H6K4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OPA3Q9H6K4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OPA3Q9H6K4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OPA3Q9H6K4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OPA3Q9H6K4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPA3Q9H6K4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPA3Q9H6K4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPA3Q9H6K4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPA3Q9H6K4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPA3Q9H6K4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
OPA3Q9H6K4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPA3Q9H6K4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPA3Q9H6K4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPA3Q9H6K4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPA3Q9H6K4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPA3Q9H6K4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPA3Q9H6K4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPA3Q9H6K4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPA3Q9H6K4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPA3Q9H6K4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPA3Q9H6K4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPA3Q9H6K4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPA3Q9H6K4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPA3Q9H6K4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OPA3Q9H6K4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OPA3Q9H6K4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OPA3Q9H6K4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
OPA3Q9H6K4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
OPA3Q9H6K4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
OPA3Q9H6K4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
OPA3Q9H6K4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPA3Q9H6K4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPA3Q9H6K4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPA3Q9H6K4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPA3Q9H6K4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPA3Q9H6K4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
OPA3Q9H6K4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPA3Q9H6K4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPA3Q9H6K4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPA3Q9H6K4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPA3Q9H6K4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OPA3Q9H6K4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OPA3Q9H6K4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OPA3Q9H6K4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.9 ms