Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GFRA4Q9GZZ7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GFRA4Q9GZZ7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GFRA4Q9GZZ7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GFRA4Q9GZZ7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GFRA4Q9GZZ7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GFRA4Q9GZZ7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GFRA4Q9GZZ7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GFRA4Q9GZZ7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GFRA4Q9GZZ7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GFRA4Q9GZZ7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GFRA4Q9GZZ7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GFRA4Q9GZZ7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GFRA4Q9GZZ7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GFRA4Q9GZZ7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GFRA4Q9GZZ7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GFRA4Q9GZZ7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GFRA4Q9GZZ7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GFRA4Q9GZZ7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GFRA4Q9GZZ7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GFRA4Q9GZZ7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GFRA4Q9GZZ7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GFRA4Q9GZZ7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFRA4Q9GZZ7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFRA4Q9GZZ7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFRA4Q9GZZ7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFRA4Q9GZZ7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFRA4Q9GZZ7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GFRA4Q9GZZ7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms