Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC3Q9BY71 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC3Q9BY71 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC3Q9BY71 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC3Q9BY71 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC3Q9BY71 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRC3Q9BY71 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC3Q9BY71 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC3Q9BY71 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRC3Q9BY71 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC3Q9BY71 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC3Q9BY71 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC3Q9BY71 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC3Q9BY71 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRC3Q9BY71 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRC3Q9BY71 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LRRC3Q9BY71 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC3Q9BY71 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC3Q9BY71 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC3Q9BY71 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC3Q9BY71 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC3Q9BY71 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC3Q9BY71 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LRRC3Q9BY71 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC3Q9BY71 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC3Q9BY71 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC3Q9BY71 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LRRC3Q9BY71 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC3Q9BY71 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC3Q9BY71 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LRRC3Q9BY71 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC3Q9BY71 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC3Q9BY71 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC3Q9BY71 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LRRC3Q9BY71 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
LRRC3Q9BY71 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC3Q9BY71 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC3Q9BY71 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LRRC3Q9BY71 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC3Q9BY71 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LRRC3Q9BY71 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC3Q9BY71 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC3Q9BY71 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LRRC3Q9BY71 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC3Q9BY71 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC3Q9BY71 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC3Q9BY71 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LRRC3Q9BY71 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC3Q9BY71 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC3Q9BY71 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LRRC3Q9BY71 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC3Q9BY71 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LRRC3Q9BY71 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
LRRC3Q9BY71 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC3Q9BY71 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LRRC3Q9BY71 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC3Q9BY71 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC3Q9BY71 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC3Q9BY71 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LRRC3Q9BY71 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC3Q9BY71 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC3Q9BY71 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LRRC3Q9BY71 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC3Q9BY71 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC3Q9BY71 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LRRC3Q9BY71 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC3Q9BY71 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC3Q9BY71 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC3Q9BY71 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LRRC3Q9BY71 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC3Q9BY71 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LRRC3Q9BY71 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC3Q9BY71 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC3Q9BY71 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LRRC3Q9BY71 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC3Q9BY71 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LRRC3Q9BY71 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC3Q9BY71 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC3Q9BY71 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC3Q9BY71 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC3Q9BY71 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC3Q9BY71 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC3Q9BY71 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC3Q9BY71 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC3Q9BY71 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC3Q9BY71 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC3Q9BY71 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC3Q9BY71 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
LRRC3Q9BY71 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC3Q9BY71 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LRRC3Q9BY71 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC3Q9BY71 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LRRC3Q9BY71 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC3Q9BY71 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC3Q9BY71 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LRRC3Q9BY71 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LRRC3Q9BY71 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC3Q9BY71 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC3Q9BY71 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC3Q9BY71 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms