Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
PRXQ9BXM0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC42.89■■■■■ 4.46
PRXQ9BXM0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
PRXQ9BXM0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC42.88■■■■■ 4.46
PRXQ9BXM0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC42.84■■■■■ 4.45
PRXQ9BXM0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
PRXQ9BXM0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.82■■■■■ 4.45
PRXQ9BXM0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
PRXQ9BXM0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
PRXQ9BXM0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
PRXQ9BXM0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
PRXQ9BXM0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
PRXQ9BXM0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.78■■■■■ 4.44
PRXQ9BXM0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
PRXQ9BXM0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
PRXQ9BXM0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC42.77■■■■■ 4.44
PRXQ9BXM0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC42.77■■■■■ 4.44
PRXQ9BXM0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC42.77■■■■■ 4.44
PRXQ9BXM0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
PRXQ9BXM0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
PRXQ9BXM0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
PRXQ9BXM0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.74■■■■■ 4.43
PRXQ9BXM0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
PRXQ9BXM0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
PRXQ9BXM0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
PRXQ9BXM0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
PRXQ9BXM0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC42.72■■■■■ 4.43
PRXQ9BXM0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
PRXQ9BXM0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
PRXQ9BXM0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
PRXQ9BXM0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
PRXQ9BXM0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.43
PRXQ9BXM0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
PRXQ9BXM0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
PRXQ9BXM0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
PRXQ9BXM0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
PRXQ9BXM0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
PRXQ9BXM0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
PRXQ9BXM0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
PRXQ9BXM0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC42.66■■■■■ 4.42
PRXQ9BXM0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
PRXQ9BXM0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
PRXQ9BXM0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
PRXQ9BXM0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC42.65■■■■■ 4.42
PRXQ9BXM0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
PRXQ9BXM0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
PRXQ9BXM0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
PRXQ9BXM0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.42
PRXQ9BXM0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
PRXQ9BXM0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC42.61■■■■■ 4.41
PRXQ9BXM0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
PRXQ9BXM0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC42.59■■■■■ 4.41
PRXQ9BXM0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
PRXQ9BXM0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
PRXQ9BXM0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
PRXQ9BXM0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
PRXQ9BXM0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
PRXQ9BXM0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
PRXQ9BXM0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
PRXQ9BXM0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
PRXQ9BXM0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
PRXQ9BXM0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
PRXQ9BXM0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
PRXQ9BXM0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
PRXQ9BXM0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
PRXQ9BXM0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
PRXQ9BXM0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
PRXQ9BXM0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.41
PRXQ9BXM0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC42.57■■■■■ 4.41
PRXQ9BXM0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC42.57■■■■■ 4.41
PRXQ9BXM0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
PRXQ9BXM0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC42.55■■■■■ 4.4
PRXQ9BXM0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
PRXQ9BXM0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
PRXQ9BXM0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC42.52■■■■■ 4.4
PRXQ9BXM0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.39
PRXQ9BXM0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
PRXQ9BXM0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC42.5■■■■■ 4.39
PRXQ9BXM0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
PRXQ9BXM0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
PRXQ9BXM0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
PRXQ9BXM0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
PRXQ9BXM0 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
PRXQ9BXM0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
PRXQ9BXM0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC42.43■■■■■ 4.38
PRXQ9BXM0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
PRXQ9BXM0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
PRXQ9BXM0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
PRXQ9BXM0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
PRXQ9BXM0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
PRXQ9BXM0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC42.41■■■■■ 4.38
PRXQ9BXM0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
PRXQ9BXM0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
PRXQ9BXM0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
PRXQ9BXM0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
PRXQ9BXM0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
PRXQ9BXM0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.38
PRXQ9BXM0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
PRXQ9BXM0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
PRXQ9BXM0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms