Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BBS2Q9BXC9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BBS2Q9BXC9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BBS2Q9BXC9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BBS2Q9BXC9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BBS2Q9BXC9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BBS2Q9BXC9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BBS2Q9BXC9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BBS2Q9BXC9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
BBS2Q9BXC9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
BBS2Q9BXC9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BBS2Q9BXC9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BBS2Q9BXC9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BBS2Q9BXC9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BBS2Q9BXC9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BBS2Q9BXC9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BBS2Q9BXC9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BBS2Q9BXC9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BBS2Q9BXC9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BBS2Q9BXC9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BBS2Q9BXC9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BBS2Q9BXC9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BBS2Q9BXC9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BBS2Q9BXC9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BBS2Q9BXC9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BBS2Q9BXC9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BBS2Q9BXC9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BBS2Q9BXC9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BBS2Q9BXC9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BBS2Q9BXC9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BBS2Q9BXC9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BBS2Q9BXC9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
BBS2Q9BXC9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BBS2Q9BXC9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BBS2Q9BXC9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BBS2Q9BXC9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
BBS2Q9BXC9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BBS2Q9BXC9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BBS2Q9BXC9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BBS2Q9BXC9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BBS2Q9BXC9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BBS2Q9BXC9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BBS2Q9BXC9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BBS2Q9BXC9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BBS2Q9BXC9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BBS2Q9BXC9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BBS2Q9BXC9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BBS2Q9BXC9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BBS2Q9BXC9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BBS2Q9BXC9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BBS2Q9BXC9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BBS2Q9BXC9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BBS2Q9BXC9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BBS2Q9BXC9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BBS2Q9BXC9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BBS2Q9BXC9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BBS2Q9BXC9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BBS2Q9BXC9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BBS2Q9BXC9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BBS2Q9BXC9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BBS2Q9BXC9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BBS2Q9BXC9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BBS2Q9BXC9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BBS2Q9BXC9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BBS2Q9BXC9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BBS2Q9BXC9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BBS2Q9BXC9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BBS2Q9BXC9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BBS2Q9BXC9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
BBS2Q9BXC9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BBS2Q9BXC9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BBS2Q9BXC9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BBS2Q9BXC9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BBS2Q9BXC9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BBS2Q9BXC9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BBS2Q9BXC9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BBS2Q9BXC9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BBS2Q9BXC9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BBS2Q9BXC9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BBS2Q9BXC9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BBS2Q9BXC9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BBS2Q9BXC9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BBS2Q9BXC9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BBS2Q9BXC9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BBS2Q9BXC9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BBS2Q9BXC9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BBS2Q9BXC9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BBS2Q9BXC9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BBS2Q9BXC9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BBS2Q9BXC9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BBS2Q9BXC9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms