Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIGD2AQ9BW72 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIGD2AQ9BW72 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIGD2AQ9BW72 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIGD2AQ9BW72 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIGD2AQ9BW72 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIGD2AQ9BW72 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIGD2AQ9BW72 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIGD2AQ9BW72 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIGD2AQ9BW72 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIGD2AQ9BW72 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HIGD2AQ9BW72 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HIGD2AQ9BW72 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIGD2AQ9BW72 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HIGD2AQ9BW72 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HIGD2AQ9BW72 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms