Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MKNK1Q9BUB5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MKNK1Q9BUB5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MKNK1Q9BUB5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MKNK1Q9BUB5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MKNK1Q9BUB5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MKNK1Q9BUB5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MKNK1Q9BUB5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MKNK1Q9BUB5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MKNK1Q9BUB5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MKNK1Q9BUB5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MKNK1Q9BUB5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MKNK1Q9BUB5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MKNK1Q9BUB5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MKNK1Q9BUB5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MKNK1Q9BUB5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MKNK1Q9BUB5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MKNK1Q9BUB5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MKNK1Q9BUB5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MKNK1Q9BUB5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MKNK1Q9BUB5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MKNK1Q9BUB5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MKNK1Q9BUB5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MKNK1Q9BUB5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MKNK1Q9BUB5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MKNK1Q9BUB5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MKNK1Q9BUB5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MKNK1Q9BUB5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MKNK1Q9BUB5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MKNK1Q9BUB5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MKNK1Q9BUB5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MKNK1Q9BUB5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MKNK1Q9BUB5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MKNK1Q9BUB5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MKNK1Q9BUB5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MKNK1Q9BUB5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MKNK1Q9BUB5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MKNK1Q9BUB5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKNK1Q9BUB5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKNK1Q9BUB5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MKNK1Q9BUB5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MKNK1Q9BUB5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MKNK1Q9BUB5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MKNK1Q9BUB5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MKNK1Q9BUB5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MKNK1Q9BUB5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MKNK1Q9BUB5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MKNK1Q9BUB5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MKNK1Q9BUB5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MKNK1Q9BUB5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MKNK1Q9BUB5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MKNK1Q9BUB5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MKNK1Q9BUB5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MKNK1Q9BUB5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MKNK1Q9BUB5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MKNK1Q9BUB5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MKNK1Q9BUB5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MKNK1Q9BUB5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MKNK1Q9BUB5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MKNK1Q9BUB5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MKNK1Q9BUB5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MKNK1Q9BUB5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MKNK1Q9BUB5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MKNK1Q9BUB5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MKNK1Q9BUB5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MKNK1Q9BUB5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MKNK1Q9BUB5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MKNK1Q9BUB5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MKNK1Q9BUB5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MKNK1Q9BUB5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MKNK1Q9BUB5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MKNK1Q9BUB5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MKNK1Q9BUB5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MKNK1Q9BUB5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MKNK1Q9BUB5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MKNK1Q9BUB5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MKNK1Q9BUB5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MKNK1Q9BUB5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MKNK1Q9BUB5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MKNK1Q9BUB5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MKNK1Q9BUB5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MKNK1Q9BUB5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MKNK1Q9BUB5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKNK1Q9BUB5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKNK1Q9BUB5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKNK1Q9BUB5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKNK1Q9BUB5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKNK1Q9BUB5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKNK1Q9BUB5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKNK1Q9BUB5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MKNK1Q9BUB5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MKNK1Q9BUB5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MKNK1Q9BUB5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MKNK1Q9BUB5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MKNK1Q9BUB5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MKNK1Q9BUB5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MKNK1Q9BUB5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MKNK1Q9BUB5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MKNK1Q9BUB5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MKNK1Q9BUB5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms