Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSK4

FEM1A, Protein fem-1 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEM1AQ9BSK4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FEM1AQ9BSK4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FEM1AQ9BSK4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FEM1AQ9BSK4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FEM1AQ9BSK4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
FEM1AQ9BSK4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FEM1AQ9BSK4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FEM1AQ9BSK4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FEM1AQ9BSK4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FEM1AQ9BSK4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FEM1AQ9BSK4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FEM1AQ9BSK4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FEM1AQ9BSK4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FEM1AQ9BSK4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FEM1AQ9BSK4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FEM1AQ9BSK4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FEM1AQ9BSK4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
FEM1AQ9BSK4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FEM1AQ9BSK4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FEM1AQ9BSK4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FEM1AQ9BSK4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FEM1AQ9BSK4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FEM1AQ9BSK4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FEM1AQ9BSK4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FEM1AQ9BSK4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FEM1AQ9BSK4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FEM1AQ9BSK4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FEM1AQ9BSK4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FEM1AQ9BSK4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
FEM1AQ9BSK4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FEM1AQ9BSK4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FEM1AQ9BSK4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FEM1AQ9BSK4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FEM1AQ9BSK4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FEM1AQ9BSK4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FEM1AQ9BSK4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FEM1AQ9BSK4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FEM1AQ9BSK4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FEM1AQ9BSK4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FEM1AQ9BSK4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms