Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUBGCP2Q9BSJ2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUBGCP2Q9BSJ2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUBGCP2Q9BSJ2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUBGCP2Q9BSJ2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUBGCP2Q9BSJ2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUBGCP2Q9BSJ2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TUBGCP2Q9BSJ2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TUBGCP2Q9BSJ2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TUBGCP2Q9BSJ2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TUBGCP2Q9BSJ2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUBGCP2Q9BSJ2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUBGCP2Q9BSJ2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUBGCP2Q9BSJ2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUBGCP2Q9BSJ2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TUBGCP2Q9BSJ2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBGCP2Q9BSJ2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBGCP2Q9BSJ2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBGCP2Q9BSJ2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUBGCP2Q9BSJ2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBGCP2Q9BSJ2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBGCP2Q9BSJ2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBGCP2Q9BSJ2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TUBGCP2Q9BSJ2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TUBGCP2Q9BSJ2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TUBGCP2Q9BSJ2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TUBGCP2Q9BSJ2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TUBGCP2Q9BSJ2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TUBGCP2Q9BSJ2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TUBGCP2Q9BSJ2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TUBGCP2Q9BSJ2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TUBGCP2Q9BSJ2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TUBGCP2Q9BSJ2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TUBGCP2Q9BSJ2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TUBGCP2Q9BSJ2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TUBGCP2Q9BSJ2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUBGCP2Q9BSJ2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUBGCP2Q9BSJ2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUBGCP2Q9BSJ2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUBGCP2Q9BSJ2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUBGCP2Q9BSJ2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUBGCP2Q9BSJ2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUBGCP2Q9BSJ2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUBGCP2Q9BSJ2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TUBGCP2Q9BSJ2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TUBGCP2Q9BSJ2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TUBGCP2Q9BSJ2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TUBGCP2Q9BSJ2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TUBGCP2Q9BSJ2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TUBGCP2Q9BSJ2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TUBGCP2Q9BSJ2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TUBGCP2Q9BSJ2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TUBGCP2Q9BSJ2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TUBGCP2Q9BSJ2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBGCP2Q9BSJ2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TUBGCP2Q9BSJ2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TUBGCP2Q9BSJ2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUBGCP2Q9BSJ2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TUBGCP2Q9BSJ2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TUBGCP2Q9BSJ2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TUBGCP2Q9BSJ2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TUBGCP2Q9BSJ2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TUBGCP2Q9BSJ2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TUBGCP2Q9BSJ2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TUBGCP2Q9BSJ2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TUBGCP2Q9BSJ2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TUBGCP2Q9BSJ2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TUBGCP2Q9BSJ2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TUBGCP2Q9BSJ2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TUBGCP2Q9BSJ2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TUBGCP2Q9BSJ2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TUBGCP2Q9BSJ2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TUBGCP2Q9BSJ2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TUBGCP2Q9BSJ2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TUBGCP2Q9BSJ2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TUBGCP2Q9BSJ2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TUBGCP2Q9BSJ2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TUBGCP2Q9BSJ2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TUBGCP2Q9BSJ2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TUBGCP2Q9BSJ2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TUBGCP2Q9BSJ2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TUBGCP2Q9BSJ2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TUBGCP2Q9BSJ2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TUBGCP2Q9BSJ2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TUBGCP2Q9BSJ2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TUBGCP2Q9BSJ2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TUBGCP2Q9BSJ2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TUBGCP2Q9BSJ2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TUBGCP2Q9BSJ2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TUBGCP2Q9BSJ2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TUBGCP2Q9BSJ2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TUBGCP2Q9BSJ2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TUBGCP2Q9BSJ2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms