Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C2orf88Q9BSF0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C2orf88Q9BSF0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
C2orf88Q9BSF0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
C2orf88Q9BSF0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms