Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM175Q9BSA9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM175Q9BSA9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM175Q9BSA9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM175Q9BSA9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM175Q9BSA9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM175Q9BSA9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM175Q9BSA9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM175Q9BSA9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM175Q9BSA9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM175Q9BSA9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM175Q9BSA9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM175Q9BSA9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM175Q9BSA9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM175Q9BSA9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM175Q9BSA9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM175Q9BSA9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM175Q9BSA9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM175Q9BSA9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM175Q9BSA9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM175Q9BSA9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM175Q9BSA9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMEM175Q9BSA9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM175Q9BSA9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM175Q9BSA9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM175Q9BSA9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM175Q9BSA9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM175Q9BSA9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMEM175Q9BSA9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM175Q9BSA9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM175Q9BSA9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMEM175Q9BSA9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM175Q9BSA9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM175Q9BSA9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM175Q9BSA9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM175Q9BSA9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM175Q9BSA9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM175Q9BSA9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM175Q9BSA9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM175Q9BSA9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMEM175Q9BSA9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM175Q9BSA9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMEM175Q9BSA9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM175Q9BSA9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM175Q9BSA9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM175Q9BSA9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMEM175Q9BSA9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM175Q9BSA9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM175Q9BSA9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM175Q9BSA9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TMEM175Q9BSA9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM175Q9BSA9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM175Q9BSA9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM175Q9BSA9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMEM175Q9BSA9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM175Q9BSA9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM175Q9BSA9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMEM175Q9BSA9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMEM175Q9BSA9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM175Q9BSA9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMEM175Q9BSA9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMEM175Q9BSA9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM175Q9BSA9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM175Q9BSA9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TMEM175Q9BSA9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM175Q9BSA9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMEM175Q9BSA9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM175Q9BSA9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM175Q9BSA9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMEM175Q9BSA9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM175Q9BSA9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM175Q9BSA9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMEM175Q9BSA9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM175Q9BSA9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM175Q9BSA9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM175Q9BSA9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM175Q9BSA9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMEM175Q9BSA9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TMEM175Q9BSA9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM175Q9BSA9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM175Q9BSA9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMEM175Q9BSA9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM175Q9BSA9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM175Q9BSA9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM175Q9BSA9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TMEM175Q9BSA9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM175Q9BSA9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM175Q9BSA9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM175Q9BSA9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TMEM175Q9BSA9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM175Q9BSA9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM175Q9BSA9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM175Q9BSA9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM175Q9BSA9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM175Q9BSA9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM175Q9BSA9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM175Q9BSA9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM175Q9BSA9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM175Q9BSA9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM175Q9BSA9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms