Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQN1

FAM83C, Protein FAM83C, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83CQ9BQN1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM83CQ9BQN1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM83CQ9BQN1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM83CQ9BQN1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM83CQ9BQN1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM83CQ9BQN1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM83CQ9BQN1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM83CQ9BQN1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM83CQ9BQN1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM83CQ9BQN1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM83CQ9BQN1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM83CQ9BQN1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM83CQ9BQN1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM83CQ9BQN1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM83CQ9BQN1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM83CQ9BQN1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM83CQ9BQN1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM83CQ9BQN1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM83CQ9BQN1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM83CQ9BQN1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM83CQ9BQN1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM83CQ9BQN1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FAM83CQ9BQN1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FAM83CQ9BQN1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM83CQ9BQN1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM83CQ9BQN1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM83CQ9BQN1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM83CQ9BQN1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM83CQ9BQN1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM83CQ9BQN1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM83CQ9BQN1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM83CQ9BQN1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM83CQ9BQN1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM83CQ9BQN1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM83CQ9BQN1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM83CQ9BQN1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM83CQ9BQN1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM83CQ9BQN1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM83CQ9BQN1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM83CQ9BQN1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM83CQ9BQN1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM83CQ9BQN1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM83CQ9BQN1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM83CQ9BQN1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM83CQ9BQN1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM83CQ9BQN1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM83CQ9BQN1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM83CQ9BQN1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM83CQ9BQN1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM83CQ9BQN1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM83CQ9BQN1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM83CQ9BQN1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM83CQ9BQN1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM83CQ9BQN1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM83CQ9BQN1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM83CQ9BQN1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM83CQ9BQN1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM83CQ9BQN1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM83CQ9BQN1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM83CQ9BQN1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM83CQ9BQN1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM83CQ9BQN1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
FAM83CQ9BQN1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
FAM83CQ9BQN1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM83CQ9BQN1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM83CQ9BQN1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM83CQ9BQN1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM83CQ9BQN1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM83CQ9BQN1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM83CQ9BQN1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM83CQ9BQN1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM83CQ9BQN1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM83CQ9BQN1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM83CQ9BQN1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM83CQ9BQN1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM83CQ9BQN1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM83CQ9BQN1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM83CQ9BQN1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM83CQ9BQN1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FAM83CQ9BQN1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM83CQ9BQN1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM83CQ9BQN1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM83CQ9BQN1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM83CQ9BQN1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM83CQ9BQN1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM83CQ9BQN1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM83CQ9BQN1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM83CQ9BQN1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM83CQ9BQN1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM83CQ9BQN1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAM83CQ9BQN1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM83CQ9BQN1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM83CQ9BQN1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM83CQ9BQN1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM83CQ9BQN1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM83CQ9BQN1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM83CQ9BQN1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM83CQ9BQN1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FAM83CQ9BQN1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FAM83CQ9BQN1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms