Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCK3Q9BQ16 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCK3Q9BQ16 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCK3Q9BQ16 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCK3Q9BQ16 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPOCK3Q9BQ16 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPOCK3Q9BQ16 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPOCK3Q9BQ16 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPOCK3Q9BQ16 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SPOCK3Q9BQ16 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCK3Q9BQ16 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCK3Q9BQ16 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCK3Q9BQ16 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCK3Q9BQ16 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCK3Q9BQ16 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPOCK3Q9BQ16 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPOCK3Q9BQ16 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPOCK3Q9BQ16 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPOCK3Q9BQ16 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPOCK3Q9BQ16 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPOCK3Q9BQ16 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPOCK3Q9BQ16 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPOCK3Q9BQ16 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPOCK3Q9BQ16 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCK3Q9BQ16 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCK3Q9BQ16 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCK3Q9BQ16 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPOCK3Q9BQ16 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPOCK3Q9BQ16 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPOCK3Q9BQ16 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPOCK3Q9BQ16 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPOCK3Q9BQ16 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPOCK3Q9BQ16 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPOCK3Q9BQ16 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPOCK3Q9BQ16 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPOCK3Q9BQ16 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPOCK3Q9BQ16 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPOCK3Q9BQ16 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPOCK3Q9BQ16 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPOCK3Q9BQ16 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPOCK3Q9BQ16 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SPOCK3Q9BQ16 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPOCK3Q9BQ16 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPOCK3Q9BQ16 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPOCK3Q9BQ16 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPOCK3Q9BQ16 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPOCK3Q9BQ16 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPOCK3Q9BQ16 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPOCK3Q9BQ16 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPOCK3Q9BQ16 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPOCK3Q9BQ16 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPOCK3Q9BQ16 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPOCK3Q9BQ16 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPOCK3Q9BQ16 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPOCK3Q9BQ16 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPOCK3Q9BQ16 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPOCK3Q9BQ16 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPOCK3Q9BQ16 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPOCK3Q9BQ16 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPOCK3Q9BQ16 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPOCK3Q9BQ16 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPOCK3Q9BQ16 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPOCK3Q9BQ16 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPOCK3Q9BQ16 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPOCK3Q9BQ16 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPOCK3Q9BQ16 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPOCK3Q9BQ16 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPOCK3Q9BQ16 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SPOCK3Q9BQ16 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPOCK3Q9BQ16 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPOCK3Q9BQ16 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPOCK3Q9BQ16 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPOCK3Q9BQ16 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPOCK3Q9BQ16 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPOCK3Q9BQ16 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPOCK3Q9BQ16 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPOCK3Q9BQ16 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPOCK3Q9BQ16 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPOCK3Q9BQ16 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPOCK3Q9BQ16 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPOCK3Q9BQ16 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SPOCK3Q9BQ16 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPOCK3Q9BQ16 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPOCK3Q9BQ16 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPOCK3Q9BQ16 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPOCK3Q9BQ16 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPOCK3Q9BQ16 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPOCK3Q9BQ16 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SPOCK3Q9BQ16 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPOCK3Q9BQ16 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPOCK3Q9BQ16 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPOCK3Q9BQ16 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SPOCK3Q9BQ16 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SPOCK3Q9BQ16 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPOCK3Q9BQ16 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SPOCK3Q9BQ16 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SPOCK3Q9BQ16 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
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