Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PKP2Q99959 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKP2Q99959 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKP2Q99959 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKP2Q99959 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PKP2Q99959 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKP2Q99959 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKP2Q99959 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKP2Q99959 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PKP2Q99959 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKP2Q99959 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PKP2Q99959 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PKP2Q99959 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PKP2Q99959 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKP2Q99959 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKP2Q99959 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKP2Q99959 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PKP2Q99959 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKP2Q99959 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKP2Q99959 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PKP2Q99959 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKP2Q99959 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKP2Q99959 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKP2Q99959 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PKP2Q99959 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKP2Q99959 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKP2Q99959 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKP2Q99959 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKP2Q99959 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKP2Q99959 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKP2Q99959 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKP2Q99959 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKP2Q99959 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKP2Q99959 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKP2Q99959 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP2Q99959 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP2Q99959 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP2Q99959 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKP2Q99959 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKP2Q99959 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKP2Q99959 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKP2Q99959 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKP2Q99959 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKP2Q99959 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKP2Q99959 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKP2Q99959 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKP2Q99959 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKP2Q99959 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKP2Q99959 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKP2Q99959 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKP2Q99959 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKP2Q99959 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKP2Q99959 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKP2Q99959 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKP2Q99959 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKP2Q99959 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKP2Q99959 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKP2Q99959 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKP2Q99959 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKP2Q99959 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PKP2Q99959 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PKP2Q99959 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PKP2Q99959 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKP2Q99959 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKP2Q99959 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKP2Q99959 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PKP2Q99959 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKP2Q99959 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PKP2Q99959 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKP2Q99959 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PKP2Q99959 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms