Protein–RNA interactions for Protein: Q99741

CDC6, Cell division control protein 6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC6Q99741 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC6Q99741 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC6Q99741 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC6Q99741 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC6Q99741 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC6Q99741 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC6Q99741 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC6Q99741 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC6Q99741 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC6Q99741 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC6Q99741 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC6Q99741 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC6Q99741 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC6Q99741 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC6Q99741 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC6Q99741 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC6Q99741 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC6Q99741 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC6Q99741 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC6Q99741 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC6Q99741 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC6Q99741 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC6Q99741 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC6Q99741 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC6Q99741 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC6Q99741 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC6Q99741 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC6Q99741 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC6Q99741 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC6Q99741 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC6Q99741 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC6Q99741 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC6Q99741 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC6Q99741 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC6Q99741 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC6Q99741 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC6Q99741 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC6Q99741 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC6Q99741 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC6Q99741 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC6Q99741 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC6Q99741 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC6Q99741 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC6Q99741 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC6Q99741 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC6Q99741 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC6Q99741 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC6Q99741 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC6Q99741 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC6Q99741 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC6Q99741 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC6Q99741 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC6Q99741 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC6Q99741 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC6Q99741 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC6Q99741 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC6Q99741 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC6Q99741 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC6Q99741 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC6Q99741 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC6Q99741 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC6Q99741 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC6Q99741 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC6Q99741 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC6Q99741 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC6Q99741 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDC6Q99741 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC6Q99741 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC6Q99741 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC6Q99741 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC6Q99741 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC6Q99741 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC6Q99741 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC6Q99741 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC6Q99741 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC6Q99741 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC6Q99741 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC6Q99741 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC6Q99741 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC6Q99741 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC6Q99741 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC6Q99741 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC6Q99741 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC6Q99741 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC6Q99741 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC6Q99741 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC6Q99741 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC6Q99741 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC6Q99741 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC6Q99741 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC6Q99741 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC6Q99741 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC6Q99741 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC6Q99741 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDC6Q99741 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC6Q99741 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC6Q99741 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDC6Q99741 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC6Q99741 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDC6Q99741 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms