Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF18Q99633 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF18Q99633 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF18Q99633 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF18Q99633 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF18Q99633 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF18Q99633 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF18Q99633 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF18Q99633 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF18Q99633 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF18Q99633 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF18Q99633 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF18Q99633 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF18Q99633 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF18Q99633 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF18Q99633 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF18Q99633 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF18Q99633 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF18Q99633 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF18Q99633 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF18Q99633 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF18Q99633 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF18Q99633 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF18Q99633 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF18Q99633 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF18Q99633 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRPF18Q99633 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF18Q99633 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF18Q99633 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF18Q99633 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF18Q99633 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF18Q99633 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF18Q99633 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF18Q99633 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF18Q99633 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF18Q99633 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF18Q99633 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF18Q99633 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF18Q99633 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF18Q99633 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF18Q99633 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF18Q99633 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF18Q99633 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF18Q99633 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF18Q99633 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF18Q99633 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF18Q99633 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF18Q99633 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF18Q99633 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF18Q99633 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF18Q99633 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF18Q99633 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF18Q99633 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF18Q99633 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF18Q99633 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRPF18Q99633 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF18Q99633 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF18Q99633 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRPF18Q99633 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRPF18Q99633 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF18Q99633 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF18Q99633 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF18Q99633 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF18Q99633 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRPF18Q99633 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF18Q99633 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF18Q99633 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF18Q99633 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRPF18Q99633 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF18Q99633 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF18Q99633 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF18Q99633 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRPF18Q99633 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRPF18Q99633 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF18Q99633 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF18Q99633 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF18Q99633 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRPF18Q99633 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF18Q99633 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRPF18Q99633 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF18Q99633 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRPF18Q99633 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF18Q99633 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF18Q99633 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRPF18Q99633 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRPF18Q99633 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF18Q99633 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF18Q99633 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF18Q99633 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF18Q99633 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF18Q99633 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF18Q99633 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF18Q99633 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF18Q99633 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF18Q99633 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF18Q99633 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF18Q99633 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF18Q99633 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF18Q99633 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF18Q99633 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms