Protein–RNA interactions for Protein: Q96S66

CLCC1, Chloride channel CLIC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCC1Q96S66 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLCC1Q96S66 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLCC1Q96S66 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLCC1Q96S66 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLCC1Q96S66 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCC1Q96S66 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCC1Q96S66 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCC1Q96S66 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCC1Q96S66 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLCC1Q96S66 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLCC1Q96S66 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLCC1Q96S66 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLCC1Q96S66 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLCC1Q96S66 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLCC1Q96S66 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLCC1Q96S66 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLCC1Q96S66 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLCC1Q96S66 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLCC1Q96S66 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLCC1Q96S66 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLCC1Q96S66 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLCC1Q96S66 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLCC1Q96S66 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLCC1Q96S66 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCC1Q96S66 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CLCC1Q96S66 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLCC1Q96S66 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLCC1Q96S66 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLCC1Q96S66 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLCC1Q96S66 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCC1Q96S66 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCC1Q96S66 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCC1Q96S66 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCC1Q96S66 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCC1Q96S66 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLCC1Q96S66 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLCC1Q96S66 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLCC1Q96S66 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLCC1Q96S66 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms