Protein–RNA interactions for Protein: Q96S06

LMF1, Lipase maturation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMF1Q96S06 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMF1Q96S06 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMF1Q96S06 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMF1Q96S06 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMF1Q96S06 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMF1Q96S06 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMF1Q96S06 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMF1Q96S06 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMF1Q96S06 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMF1Q96S06 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMF1Q96S06 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMF1Q96S06 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LMF1Q96S06 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMF1Q96S06 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMF1Q96S06 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMF1Q96S06 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LMF1Q96S06 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMF1Q96S06 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMF1Q96S06 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMF1Q96S06 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMF1Q96S06 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMF1Q96S06 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMF1Q96S06 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMF1Q96S06 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMF1Q96S06 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LMF1Q96S06 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMF1Q96S06 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMF1Q96S06 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMF1Q96S06 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMF1Q96S06 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMF1Q96S06 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMF1Q96S06 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMF1Q96S06 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMF1Q96S06 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMF1Q96S06 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMF1Q96S06 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMF1Q96S06 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMF1Q96S06 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMF1Q96S06 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMF1Q96S06 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMF1Q96S06 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMF1Q96S06 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMF1Q96S06 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMF1Q96S06 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMF1Q96S06 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMF1Q96S06 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LMF1Q96S06 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMF1Q96S06 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMF1Q96S06 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMF1Q96S06 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMF1Q96S06 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LMF1Q96S06 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LMF1Q96S06 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMF1Q96S06 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMF1Q96S06 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMF1Q96S06 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LMF1Q96S06 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LMF1Q96S06 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LMF1Q96S06 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms