Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG1Q96Q15 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG1Q96Q15 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG1Q96Q15 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMG1Q96Q15 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SMG1Q96Q15 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMG1Q96Q15 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG1Q96Q15 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG1Q96Q15 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG1Q96Q15 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG1Q96Q15 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG1Q96Q15 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMG1Q96Q15 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMG1Q96Q15 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMG1Q96Q15 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMG1Q96Q15 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMG1Q96Q15 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMG1Q96Q15 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMG1Q96Q15 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMG1Q96Q15 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMG1Q96Q15 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SMG1Q96Q15 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMG1Q96Q15 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMG1Q96Q15 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMG1Q96Q15 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMG1Q96Q15 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMG1Q96Q15 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMG1Q96Q15 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG1Q96Q15 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMG1Q96Q15 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG1Q96Q15 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMG1Q96Q15 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMG1Q96Q15 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMG1Q96Q15 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMG1Q96Q15 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMG1Q96Q15 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMG1Q96Q15 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMG1Q96Q15 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMG1Q96Q15 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMG1Q96Q15 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMG1Q96Q15 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMG1Q96Q15 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMG1Q96Q15 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG1Q96Q15 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG1Q96Q15 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG1Q96Q15 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG1Q96Q15 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMG1Q96Q15 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMG1Q96Q15 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMG1Q96Q15 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMG1Q96Q15 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG1Q96Q15 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG1Q96Q15 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG1Q96Q15 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG1Q96Q15 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG1Q96Q15 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG1Q96Q15 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG1Q96Q15 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG1Q96Q15 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG1Q96Q15 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG1Q96Q15 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG1Q96Q15 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG1Q96Q15 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG1Q96Q15 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG1Q96Q15 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMG1Q96Q15 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMG1Q96Q15 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMG1Q96Q15 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMG1Q96Q15 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMG1Q96Q15 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMG1Q96Q15 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMG1Q96Q15 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMG1Q96Q15 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMG1Q96Q15 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMG1Q96Q15 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMG1Q96Q15 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMG1Q96Q15 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMG1Q96Q15 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMG1Q96Q15 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMG1Q96Q15 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMG1Q96Q15 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMG1Q96Q15 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMG1Q96Q15 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SMG1Q96Q15 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMG1Q96Q15 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMG1Q96Q15 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMG1Q96Q15 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG1Q96Q15 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMG1Q96Q15 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMG1Q96Q15 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMG1Q96Q15 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMG1Q96Q15 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMG1Q96Q15 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMG1Q96Q15 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMG1Q96Q15 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMG1Q96Q15 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMG1Q96Q15 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMG1Q96Q15 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMG1Q96Q15 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMG1Q96Q15 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
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