Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD4LQ96PU5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD4LQ96PU5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NEDD4LQ96PU5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD4LQ96PU5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD4LQ96PU5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD4LQ96PU5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD4LQ96PU5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD4LQ96PU5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NEDD4LQ96PU5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD4LQ96PU5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD4LQ96PU5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD4LQ96PU5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD4LQ96PU5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD4LQ96PU5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD4LQ96PU5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD4LQ96PU5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD4LQ96PU5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD4LQ96PU5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD4LQ96PU5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEDD4LQ96PU5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD4LQ96PU5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD4LQ96PU5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD4LQ96PU5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD4LQ96PU5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD4LQ96PU5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD4LQ96PU5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD4LQ96PU5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD4LQ96PU5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD4LQ96PU5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD4LQ96PU5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD4LQ96PU5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD4LQ96PU5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD4LQ96PU5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD4LQ96PU5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD4LQ96PU5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD4LQ96PU5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD4LQ96PU5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD4LQ96PU5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NEDD4LQ96PU5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD4LQ96PU5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD4LQ96PU5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NEDD4LQ96PU5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4LQ96PU5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4LQ96PU5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NEDD4LQ96PU5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEDD4LQ96PU5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NEDD4LQ96PU5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD4LQ96PU5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD4LQ96PU5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD4LQ96PU5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NEDD4LQ96PU5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD4LQ96PU5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD4LQ96PU5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD4LQ96PU5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NEDD4LQ96PU5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD4LQ96PU5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD4LQ96PU5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NEDD4LQ96PU5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD4LQ96PU5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD4LQ96PU5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD4LQ96PU5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NEDD4LQ96PU5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NEDD4LQ96PU5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD4LQ96PU5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD4LQ96PU5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD4LQ96PU5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NEDD4LQ96PU5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD4LQ96PU5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD4LQ96PU5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NEDD4LQ96PU5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NEDD4LQ96PU5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4LQ96PU5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4LQ96PU5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4LQ96PU5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NEDD4LQ96PU5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD4LQ96PU5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NEDD4LQ96PU5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NEDD4LQ96PU5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4LQ96PU5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4LQ96PU5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4LQ96PU5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4LQ96PU5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4LQ96PU5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NEDD4LQ96PU5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD4LQ96PU5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NEDD4LQ96PU5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD4LQ96PU5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD4LQ96PU5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NEDD4LQ96PU5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD4LQ96PU5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NEDD4LQ96PU5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD4LQ96PU5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD4LQ96PU5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NEDD4LQ96PU5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD4LQ96PU5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD4LQ96PU5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NEDD4LQ96PU5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD4LQ96PU5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NEDD4LQ96PU5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms