Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AGAP4Q96P64 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AGAP4Q96P64 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGAP4Q96P64 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGAP4Q96P64 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AGAP4Q96P64 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP4Q96P64 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP4Q96P64 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP4Q96P64 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP4Q96P64 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP4Q96P64 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AGAP4Q96P64 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGAP4Q96P64 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGAP4Q96P64 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGAP4Q96P64 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGAP4Q96P64 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AGAP4Q96P64 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGAP4Q96P64 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGAP4Q96P64 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGAP4Q96P64 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AGAP4Q96P64 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGAP4Q96P64 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AGAP4Q96P64 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGAP4Q96P64 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AGAP4Q96P64 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AGAP4Q96P64 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP4Q96P64 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP4Q96P64 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP4Q96P64 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AGAP4Q96P64 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGAP4Q96P64 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGAP4Q96P64 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AGAP4Q96P64 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGAP4Q96P64 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AGAP4Q96P64 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGAP4Q96P64 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AGAP4Q96P64 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGAP4Q96P64 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGAP4Q96P64 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGAP4Q96P64 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGAP4Q96P64 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AGAP4Q96P64 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AGAP4Q96P64 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AGAP4Q96P64 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP4Q96P64 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP4Q96P64 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP4Q96P64 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AGAP4Q96P64 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP4Q96P64 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP4Q96P64 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AGAP4Q96P64 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP4Q96P64 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP4Q96P64 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP4Q96P64 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP4Q96P64 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP4Q96P64 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP4Q96P64 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP4Q96P64 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP4Q96P64 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP4Q96P64 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
AGAP4Q96P64 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP4Q96P64 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AGAP4Q96P64 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP4Q96P64 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AGAP4Q96P64 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGAP4Q96P64 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AGAP4Q96P64 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGAP4Q96P64 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGAP4Q96P64 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGAP4Q96P64 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
AGAP4Q96P64 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP4Q96P64 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
AGAP4Q96P64 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AGAP4Q96P64 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGAP4Q96P64 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
AGAP4Q96P64 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP4Q96P64 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP4Q96P64 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP4Q96P64 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP4Q96P64 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP4Q96P64 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AGAP4Q96P64 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AGAP4Q96P64 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
AGAP4Q96P64 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGAP4Q96P64 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGAP4Q96P64 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGAP4Q96P64 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGAP4Q96P64 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AGAP4Q96P64 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP4Q96P64 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP4Q96P64 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP4Q96P64 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP4Q96P64 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AGAP4Q96P64 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP4Q96P64 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP4Q96P64 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP4Q96P64 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AGAP4Q96P64 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AGAP4Q96P64 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AGAP4Q96P64 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms