Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD11Q96NU1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD11Q96NU1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD11Q96NU1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SAMD11Q96NU1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMD11Q96NU1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SAMD11Q96NU1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD11Q96NU1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD11Q96NU1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD11Q96NU1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SAMD11Q96NU1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SAMD11Q96NU1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SAMD11Q96NU1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SAMD11Q96NU1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SAMD11Q96NU1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SAMD11Q96NU1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SAMD11Q96NU1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SAMD11Q96NU1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SAMD11Q96NU1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SAMD11Q96NU1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SAMD11Q96NU1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SAMD11Q96NU1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SAMD11Q96NU1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SAMD11Q96NU1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SAMD11Q96NU1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SAMD11Q96NU1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SAMD11Q96NU1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SAMD11Q96NU1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SAMD11Q96NU1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SAMD11Q96NU1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SAMD11Q96NU1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SAMD11Q96NU1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SAMD11Q96NU1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SAMD11Q96NU1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SAMD11Q96NU1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SAMD11Q96NU1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SAMD11Q96NU1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SAMD11Q96NU1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SAMD11Q96NU1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SAMD11Q96NU1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SAMD11Q96NU1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SAMD11Q96NU1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SAMD11Q96NU1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SAMD11Q96NU1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SAMD11Q96NU1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SAMD11Q96NU1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SAMD11Q96NU1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SAMD11Q96NU1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SAMD11Q96NU1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SAMD11Q96NU1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SAMD11Q96NU1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SAMD11Q96NU1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SAMD11Q96NU1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SAMD11Q96NU1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SAMD11Q96NU1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SAMD11Q96NU1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SAMD11Q96NU1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SAMD11Q96NU1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SAMD11Q96NU1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SAMD11Q96NU1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SAMD11Q96NU1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SAMD11Q96NU1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SAMD11Q96NU1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SAMD11Q96NU1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SAMD11Q96NU1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SAMD11Q96NU1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SAMD11Q96NU1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SAMD11Q96NU1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SAMD11Q96NU1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SAMD11Q96NU1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SAMD11Q96NU1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SAMD11Q96NU1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SAMD11Q96NU1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SAMD11Q96NU1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SAMD11Q96NU1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SAMD11Q96NU1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SAMD11Q96NU1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SAMD11Q96NU1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SAMD11Q96NU1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SAMD11Q96NU1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SAMD11Q96NU1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SAMD11Q96NU1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SAMD11Q96NU1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SAMD11Q96NU1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SAMD11Q96NU1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SAMD11Q96NU1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SAMD11Q96NU1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SAMD11Q96NU1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SAMD11Q96NU1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SAMD11Q96NU1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SAMD11Q96NU1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SAMD11Q96NU1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SAMD11Q96NU1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SAMD11Q96NU1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SAMD11Q96NU1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SAMD11Q96NU1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SAMD11Q96NU1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SAMD11Q96NU1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SAMD11Q96NU1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SAMD11Q96NU1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms