Protein–RNA interactions for Protein: Q96GX2

ATXN7L3B, Ataxin-7-like protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L3BQ96GX2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATXN7L3BQ96GX2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATXN7L3BQ96GX2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATXN7L3BQ96GX2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATXN7L3BQ96GX2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATXN7L3BQ96GX2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATXN7L3BQ96GX2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATXN7L3BQ96GX2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATXN7L3BQ96GX2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATXN7L3BQ96GX2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATXN7L3BQ96GX2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ATXN7L3BQ96GX2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATXN7L3BQ96GX2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATXN7L3BQ96GX2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ATXN7L3BQ96GX2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATXN7L3BQ96GX2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATXN7L3BQ96GX2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATXN7L3BQ96GX2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATXN7L3BQ96GX2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATXN7L3BQ96GX2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATXN7L3BQ96GX2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ATXN7L3BQ96GX2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATXN7L3BQ96GX2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATXN7L3BQ96GX2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATXN7L3BQ96GX2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATXN7L3BQ96GX2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATXN7L3BQ96GX2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATXN7L3BQ96GX2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATXN7L3BQ96GX2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATXN7L3BQ96GX2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATXN7L3BQ96GX2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATXN7L3BQ96GX2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATXN7L3BQ96GX2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATXN7L3BQ96GX2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATXN7L3BQ96GX2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATXN7L3BQ96GX2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATXN7L3BQ96GX2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATXN7L3BQ96GX2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATXN7L3BQ96GX2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATXN7L3BQ96GX2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATXN7L3BQ96GX2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATXN7L3BQ96GX2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATXN7L3BQ96GX2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATXN7L3BQ96GX2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATXN7L3BQ96GX2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATXN7L3BQ96GX2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATXN7L3BQ96GX2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATXN7L3BQ96GX2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATXN7L3BQ96GX2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATXN7L3BQ96GX2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATXN7L3BQ96GX2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATXN7L3BQ96GX2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATXN7L3BQ96GX2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATXN7L3BQ96GX2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATXN7L3BQ96GX2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATXN7L3BQ96GX2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATXN7L3BQ96GX2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATXN7L3BQ96GX2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATXN7L3BQ96GX2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATXN7L3BQ96GX2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATXN7L3BQ96GX2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATXN7L3BQ96GX2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATXN7L3BQ96GX2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATXN7L3BQ96GX2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATXN7L3BQ96GX2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATXN7L3BQ96GX2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
ATXN7L3BQ96GX2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATXN7L3BQ96GX2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATXN7L3BQ96GX2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATXN7L3BQ96GX2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms