Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCMH1Q96GD3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCMH1Q96GD3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCMH1Q96GD3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCMH1Q96GD3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCMH1Q96GD3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCMH1Q96GD3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCMH1Q96GD3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SCMH1Q96GD3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SCMH1Q96GD3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCMH1Q96GD3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCMH1Q96GD3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SCMH1Q96GD3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCMH1Q96GD3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SCMH1Q96GD3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SCMH1Q96GD3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCMH1Q96GD3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCMH1Q96GD3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCMH1Q96GD3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SCMH1Q96GD3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SCMH1Q96GD3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCMH1Q96GD3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCMH1Q96GD3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCMH1Q96GD3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCMH1Q96GD3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCMH1Q96GD3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCMH1Q96GD3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCMH1Q96GD3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCMH1Q96GD3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCMH1Q96GD3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCMH1Q96GD3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCMH1Q96GD3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCMH1Q96GD3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCMH1Q96GD3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCMH1Q96GD3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCMH1Q96GD3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms