Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP6Q96FZ7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP6Q96FZ7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP6Q96FZ7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP6Q96FZ7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP6Q96FZ7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP6Q96FZ7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP6Q96FZ7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP6Q96FZ7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHMP6Q96FZ7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CHMP6Q96FZ7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP6Q96FZ7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP6Q96FZ7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP6Q96FZ7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHMP6Q96FZ7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP6Q96FZ7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHMP6Q96FZ7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHMP6Q96FZ7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP6Q96FZ7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP6Q96FZ7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP6Q96FZ7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHMP6Q96FZ7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP6Q96FZ7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHMP6Q96FZ7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP6Q96FZ7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHMP6Q96FZ7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHMP6Q96FZ7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHMP6Q96FZ7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHMP6Q96FZ7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHMP6Q96FZ7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP6Q96FZ7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP6Q96FZ7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP6Q96FZ7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP6Q96FZ7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP6Q96FZ7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP6Q96FZ7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP6Q96FZ7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP6Q96FZ7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP6Q96FZ7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP6Q96FZ7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP6Q96FZ7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP6Q96FZ7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP6Q96FZ7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP6Q96FZ7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP6Q96FZ7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP6Q96FZ7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP6Q96FZ7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP6Q96FZ7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP6Q96FZ7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHMP6Q96FZ7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHMP6Q96FZ7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHMP6Q96FZ7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHMP6Q96FZ7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP6Q96FZ7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP6Q96FZ7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP6Q96FZ7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP6Q96FZ7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP6Q96FZ7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP6Q96FZ7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP6Q96FZ7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP6Q96FZ7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP6Q96FZ7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP6Q96FZ7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP6Q96FZ7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP6Q96FZ7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP6Q96FZ7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP6Q96FZ7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP6Q96FZ7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHMP6Q96FZ7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP6Q96FZ7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP6Q96FZ7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHMP6Q96FZ7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP6Q96FZ7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP6Q96FZ7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP6Q96FZ7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHMP6Q96FZ7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHMP6Q96FZ7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP6Q96FZ7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHMP6Q96FZ7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP6Q96FZ7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP6Q96FZ7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP6Q96FZ7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP6Q96FZ7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP6Q96FZ7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHMP6Q96FZ7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP6Q96FZ7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP6Q96FZ7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP6Q96FZ7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP6Q96FZ7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHMP6Q96FZ7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP6Q96FZ7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP6Q96FZ7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP6Q96FZ7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP6Q96FZ7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHMP6Q96FZ7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP6Q96FZ7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP6Q96FZ7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHMP6Q96FZ7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP6Q96FZ7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHMP6Q96FZ7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms