Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PGBD4Q96DM1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PGBD4Q96DM1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PGBD4Q96DM1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PGBD4Q96DM1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PGBD4Q96DM1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PGBD4Q96DM1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PGBD4Q96DM1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PGBD4Q96DM1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PGBD4Q96DM1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PGBD4Q96DM1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PGBD4Q96DM1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PGBD4Q96DM1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PGBD4Q96DM1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PGBD4Q96DM1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PGBD4Q96DM1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PGBD4Q96DM1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PGBD4Q96DM1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PGBD4Q96DM1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PGBD4Q96DM1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PGBD4Q96DM1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PGBD4Q96DM1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PGBD4Q96DM1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PGBD4Q96DM1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PGBD4Q96DM1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PGBD4Q96DM1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PGBD4Q96DM1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PGBD4Q96DM1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PGBD4Q96DM1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PGBD4Q96DM1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PGBD4Q96DM1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PGBD4Q96DM1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PGBD4Q96DM1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PGBD4Q96DM1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PGBD4Q96DM1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PGBD4Q96DM1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PGBD4Q96DM1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PGBD4Q96DM1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PGBD4Q96DM1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PGBD4Q96DM1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PGBD4Q96DM1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PGBD4Q96DM1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PGBD4Q96DM1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PGBD4Q96DM1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PGBD4Q96DM1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PGBD4Q96DM1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PGBD4Q96DM1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PGBD4Q96DM1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PGBD4Q96DM1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PGBD4Q96DM1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PGBD4Q96DM1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PGBD4Q96DM1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PGBD4Q96DM1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PGBD4Q96DM1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PGBD4Q96DM1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PGBD4Q96DM1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PGBD4Q96DM1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PGBD4Q96DM1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PGBD4Q96DM1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PGBD4Q96DM1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PGBD4Q96DM1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PGBD4Q96DM1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PGBD4Q96DM1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PGBD4Q96DM1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PGBD4Q96DM1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PGBD4Q96DM1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PGBD4Q96DM1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PGBD4Q96DM1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PGBD4Q96DM1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PGBD4Q96DM1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PGBD4Q96DM1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PGBD4Q96DM1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PGBD4Q96DM1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PGBD4Q96DM1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PGBD4Q96DM1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PGBD4Q96DM1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PGBD4Q96DM1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PGBD4Q96DM1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PGBD4Q96DM1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PGBD4Q96DM1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PGBD4Q96DM1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PGBD4Q96DM1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PGBD4Q96DM1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PGBD4Q96DM1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PGBD4Q96DM1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PGBD4Q96DM1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PGBD4Q96DM1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PGBD4Q96DM1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PGBD4Q96DM1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PGBD4Q96DM1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PGBD4Q96DM1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PGBD4Q96DM1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PGBD4Q96DM1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PGBD4Q96DM1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PGBD4Q96DM1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PGBD4Q96DM1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PGBD4Q96DM1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PGBD4Q96DM1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PGBD4Q96DM1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PGBD4Q96DM1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms